浙大生物化学：RNA的生物合成.PPT

b）不依赖ρ-因子的终止子：含富GC的回文序列和寡聚U序列 转录终止 RNA释放 聚合酶脱离 2、真核生物的转录终止 编码链上存在转录终止的修饰点AATAAA 真核生物mRNA带有polyA尾巴 转录的过程 核心酶 ρ因子 5′pppG mRNA 5′ 3′ 3′ 5′ 启动子 结构基因 终止区 识别 起始 延伸 σ因子 5′pppG 终止 5′pppG 2-9 nt RNA 2017年：一个特殊的DNA聚合酶 来自于一种深海噬菌体NrS-1 一级结构同源于引物酶-聚合酶 无需引物 从一个特定的DNA序列起始DNA的复制 It represents a unique de novo replicative DNA polymerase that possesses features found in DNA polymerases, primases, and RNA polymerases. PNAS, 2017, doi: 10.1073/pnas.1700280114 第四节 转录后的修饰 一、原核生物RNA的加工 二、真核生物RNA的一般加工 三、RNA的拼接 一、原核生物RNA的加工 1、原核生物rRNA前体的加工 结构：每个转录单位由16S、23S、5S rRNA 以及一个或几个tRNA基因所组成。 RNAaseⅢ：裂解产生16S和23S rRNA的前体； RNAaseE：裂解产生5S rRNA前体（P5）； RNAaseM16/M23：分别切除P16和P23两端的互补序列； RNAaseM5：切除P5的两端附加序列。 RNAaseⅢ RNAaseP RNAaseM16 RNAaseM23 RNAaseM5 2、原核生物tRNA前体的加工 结构：tRNA基因大多成簇存在，或与rRNA、mRNA基因组成混合转录单位。 1）由核酸内切酶在tRNA两端切断： 5′-核酸内切酶（RNAaseP）：在tRNA5′端切开，是tRNA的5′成熟酶 3′-核酸内切酶（RNAaseF）：在tRNA近3′端处切开 2）核酸外切酶（RNAaseD）：从前体3′端逐个切去附加的序列，直至tRNA的3′端，是tRNA的3′成熟酶。 3）在3′端加上-CCAOH -CCAOH结构对接受氨酰基的活性是必要的。 一类是本身具有CCA；另一类没有，需要tRNA核苷酰转移酶催化逐个加上CCA。 4）核苷的修饰：由特定的tRNA修饰酶催化，如假尿嘧啶核苷的糖苷键发生移位反应（由尿嘧啶的N1变为C5）。 3、原核生物mRNA前体的加工 一般不加工；少数多顺反子mRNA通过核酸内切酶切成较小的单位，再行翻译。 二、真核生物RNA的一般加工 1、真核生物rRNA前体的加工 结构：由16~18S、26~28S 和5.8S rRNA基因组成一个转录单位。 5S rRNA成簇存在。 加工：由RNAaseⅢ以及其他核酸内切酶进行加工。 2、真核生物tRNA前体的加工 结构：tRNA基因成簇排列。 加工 核酸内切酶和外切酶：切去tRNA前体5′端和3′端的附加序列。 核苷酰转移酶：在tRNA3′端逐个加上CCA序列。 修饰酶：tRNA特异成份的修饰。 3、真核生物mRNA前体的一般加工 5′-端帽结构的形成(m7GpppG) O型帽子： m7G5′ppp- I型帽子： m7G5′ppp5′N1mpN2p- II型帽子： m7G5′ppp5′N1mpN2mp- 3′-端poly A尾巴的生成 由多聚腺苷酸聚合酶催化，以带3′-OH基的RNA为受体，ATP为供体，在3′端逐个加上A。 功能：保护mRNA。 mRNA内部的甲基化 真核生物mRNA的5′-端帽结构的形成 真核生物mRNA的5′-端帽结构的形成 功能：翻译过程中起识别和稳定作用。 RNA三磷酸酶 pppN1pN2p-RNA ppN1pN2p-RNA + Pi mRNA鸟苷酰转移酶 ppN1pN2p-RNA + GTP G5′ppp5′N1pN2p-RNA + PPi mRNA（鸟嘌呤-7）甲基转移酶 G5′ppp5′N1pN2p-RNA + SAM m7G5′ppp5′N1pN2p-RNA + SAH mRNA（鸟嘌呤-2）甲基转移酶 m7G5′ppp5′N1pN2p-RNA + SAM m7G5′ppp5′N1mpN2p-RNA + SAH 三、RNA的拼接 断裂基因（split gene） 外显子（exon） 内含子（intron） 从中断基因线性表达 的方式分 翻译前删除内含子 翻译绕过内含子 翻译后删除内含子 内含子定义扩充 内含子是隔断基因线性表达的序列 RNA拼接的类型 类型I自我拼接：真核生物细胞器（线粒体、叶绿体）基因、低等真核生物核rRNA基因、细菌和噬菌体的个别基因，需要游离鸟苷酸发