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来实现的,如da基因和Ac-J基因。Ac-S基因和da基因是bHLH型基因,抑制基因emc编码一个缺乏碱性区的HLH蛋白。当emc功能缺失时,da蛋白和Ac-S蛋白形成二聚体激活相应靶基因的转录,但emc蛋白的产生导致形成不能结合DNA的异源二聚体,所以在适当细胞内产生emc蛋白是抑制Ac-S/da功能所必需的。 5、亮氨酸拉链结构 在生物化学的研究中,发现某些DNA结合蛋白的一级结构C末端区段,亮氨酸总是有规律地每隔7个氨基酸就出现一次。蛋白质α-螺旋每绕一圈为3.6个氨基酸残基。这种一级结构形成α-螺旋时,亮氨酸必与螺旋轴平行而在外侧同一线上排布,每绕两圈出现一次,而且,亮氨酸R-基因上的分支侧链也露于螺旋之外成规律地相间,形成拉链式的结构。 亮氨酸拉链是由伸展的氨基酸组成,每7个氨基酸中的第7个氨基酸是亮氨酸,亮氨酸是疏水性氨基酸,排列在螺旋的一侧,所有带电荷的氨基酸残基排在另一侧。当2个蛋白质分子平行排列时,亮氨酸之间相互作用形成二聚体,形成“拉链”。在“拉链”式的蛋白质分子中,亮氨酸以外带电荷的氨基酸形式同DNA结合。如下图: 在每一个拉链蛋白质中,邻近亮氨酸重复序列的区域都是高度碱性的,能组成DNA结合的一个位点,两个碱性区对称地形成DNA结合臂与DNA结合,拉链还可以用于同源或异源二聚体的形成。 三、转录激活域与激活 当激活剂由DNA结合域与转录激活域组成时,激活剂可以直接起作用。 而辅激活剂则须要与 其他蛋白的结合,才 可以与DNA结合行驶 相应功能。 尽管蛋白质组分组成不同,但是机制是相同的,一个和基本转录复合体直接接触的激活剂有一个转录激活域,它与DNA结合域共价连接,但激活剂通过辅激活剂作用时,它们的连接方法包挎蛋白质亚基间的非共价结合。 1.基本转录复合物激活 基本转录因子促进基本转录复合体的装配,而转录激活域是通过与基本转录因子的蛋白质之间的相互作用而发挥其功能的。典型的例子如TFⅡD、TFⅡB和TFⅡA,所有这些因子参与基本转录复合体装配的早起阶段。如图: TFⅡD可能是激活剂最普遍的靶标,他可能和TAF的任何一个相结合。 TAF主要作用是提供基本转录复合体与激活剂的联系,是高水平转录所必需的,而它是由激活剂所刺激。 2、酸性激活剂激活 酵母激活剂GAL4和GCN4的转录激活域有许多负电荷,因此被称为酸性激活剂。酸性激活剂通过增强TFⅡB结合到基础起始转录复合体的能力来发挥作用。体外实验表面GAL4或VP16酸性激活剂的存在,能刺激TFⅡB结合到腺病毒启动子上的起始复合物上,VP16激活剂可以直接和TFⅡB结合。 目前,激活剂激活转录有两种通用模型。 征募模型:认为唯一的效果是提高了RNA聚合酶与启动子的结合。 诱导模型:认为激活剂了转录复合体的某些改变,比如说酶构象上的改变,提高了效率。 知识回顾Knowledge Review 基因转录调控——转录激活 在高等真核生物中,各种细胞的表型的差异很大程度上取决于那些有RNA聚合酶Ⅱ转录的可编码蛋白质的基因表达上的不同。原则上,这些基因的表达可以在任何一段上被调控。我们至少可以将它们分为5个调控位点,这一系列的过程如下所示: 基因结构的激活 转录起始 转录加工 向细胞转运 mRNA的翻译。 在真核生物中基因表达常在转录起始时受到调控。对于大多数基因来说这是主要调控点,它包挎启动子中染色质的结构改变,同时,基本转录复合体也结合到启动子上。组织特异性基因表达调控也是在转录过程中进行的,那么生物体通过什么样的调控方式进行呢?转录因子的参与或许可能很好的解释这些调控机制。 一、转录因子 转录因子:一群能与基因5`端上游特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的质蛋白分子。主要包挎三类: 基本转录因子:和RNA聚合酶一起结合于起始点和TATA盒 激活剂:是特异性识别短共有序列元件的转录因子,他们通过增加基本转录复合体结合于启动子的 效率而起作用,因此增加转录频率,是启动子充分起作用所必须的。 辅激活剂:与转录效率有关的另一组因子自身并不与DNA结合,而是通过连接激活剂和基本转录复合体。它们通过蛋白质-蛋白质相互作用起来反应。 其他:此外一些调节因子可使染色质结构改变。 激活剂结构:激活剂有着独立的DNA结合域和转录激活域。两者有着功能的独立性,DNA结合域负责结合DNA,并将转录激活域带到启动子的邻近区域;转录激活域则负责激活转录,转录激活域和基本转录复合体相互作用,这种作用与DNA结合域的取向和具体定位无关。 在研究蛋白质相互作用时候,可以利用激活剂的两个结构域独立性的特点进行研究。 二、结合域与DNA结合 激活剂要发挥激活作用,首先是它能够识别DNA上的特异序列,
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