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- 2019-08-18 发布于江西
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【分享】教你如何在CIF文件中表达氢键
本来是回答4028...同学的问题的. 但那个主题不知道为何被删除了.
看其他人也老在问, 就在这里说一说.
问题一:
向ACta Cryst. C或E投稿, 需要产生氢键表, 该怎么办呢?
正确次序如下:
1. 先在.ins中加
HTAB
(加在UNIT后面和FVAR之前的任何地方)
2. 从.lst中 查看可能的氢键,
一般会看到如下
Hydrogen bonds with H..A r(A) + 2.000 Angstroms and DHA 110 deg.
D-H d(D-H) d(H..A) DHA d(D..A) A
O25-H13 0.902 2.343 149.03 3.151 O21
O19-H3 0.864 2.168 154.00 2.969 O4 [ -x, -y, -z ]
O21-H6 0.857 1.949 144.74 2.695 O27 [ -x, -y, -z+1 ]
3. 在 .ins中, 加以下行
ACTA
BOND $H
HTAB
HTAB O25 O21
EQIV $1 -x, -y, -z
EQIV $2 -x, -y, 1-
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