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神经元的形态识别和电位发放特性
[1] [1] [2] [1] [1]
刘深泉 姚良瑾 覃秋菊 吕凡 杨志华
华南理工大学理学院数学系[1] ,广州,510640
华南理工大学化学与化工学院[2] ,广州,510640
一、引言
神经元的功能包含很多因素,几何形态和电学物理特性是两个重
要方面。在人类脑计划中[1],L-neuron 就是研究神经元形态的一个
重要项目[2],重点研究神经元的形态和特性, NeuroMorpho.Org包含
大量神经元的形态数据[3]。SenseLab Project 建立汇集神经元的理
论模型,分析神经元的电生理特性[4],其工具是 NEURON/GENESIS 建
模仿真软件[5][6]。本文从神经元的形态和物理特征入手,研究神经
元的分类和识别问题。
二、神经元的形态识别和电位发放分类
(1) 神经元的形态分类
Neuronmorpho.prg是人类脑计划的一个重要项目,它侧重于神经
元形态的研究。SenseLab Project是人类脑计划的另外一个重要项目,
它侧重神经元的信号传导模型,主要建立各类神经元和神经系统的电
缆房室模型.这里研究选用的100个神经元及其相关数据用的样本均
来自:(1)Neuronmorpho.prg的官方网站:(2)耶鲁大学神经元研究
网站.网站(1)侧重于神经元生理形态的研究和数据积累;网站(2)侧
重于神经元数学模型研究,汇集神经元和神经系统房室模型描述。
本次研究选用的 100 个神经元分为四类:大形多枝神经元,中形
多枝神经元,锥体神经元和蒲肯野神经元.部分样本形态如图 1:
图 1 样本神经元的形态
神经元的形态丰富多样, 其形态特征的提取十分困难, 文献[10]
给出下列特征参数,见下图,刻画神经元的形态区别:
图 2 神经元的形态特征
根据文献[10]特征描述和 Neuronmorpho.prg 的特征数据分类,
我们选用神经元的胞体表面积, 干的数目, 分叉数目, 分支数目,宽
度, 高度, 深度,直径, 长度,表面积,体积, 殴氏距离, 路径距离,
分叉级数,压缩比,破碎程度,非对称分化,罗尔比率(Ralls Ratio), 局
部分叉角, 远处分叉角等 20 个参数来刻画神经元形态特征.
为精确分析形态特征参数,先对数据进行标准化,主成分分析可
知,前四个主成分特征值都大于 1 ,它们共同解释了总变异的
75.761%;第五个主成分虽然解释了总变异的4.966%,但它的特征值
为 0.993,小于 1,这说明该主成分的解释力度还不如直接引入原变
量大。因此,只需要萃取出前四个主成分即可。用这四个主成分代替
原来的 20 个变量做系统聚类分类识别。
表 1 部分样本神经元的几何形态参数
Soma Eucliden Path Total Total Number Ralls
参数 Surface Distance Distance Length Volume of Ratio:
Stems:
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