基因组学技术在致基因发现.pptVIP

结果与讨论 —— miRNA差异比较 Higher Lower Fold Change 5-10 10-50 50 RS4;11 Jurkat, GM mir-320b, mir-1292, mir-222, mir-195, let-7c, mir-122, mir-1277-3p, mir-671-5p mir-125b, mir-519d, mir-3666, mir-148b mir-199b-3p, mir-4458, mir-30a Jurkat RS4;11, GM mir-223, mir-1278, mir-95, mir-9, let-7b mir-766, mir-181d, mir-92b, mir-363 NA GM RS4;11, Jurkat mir-193b, mir-223*, mir-146b-5p mir-138-5p, mir-21, mir-15b-5p mir-193b*, mir-155 miRNA显著上调比较 miRNA表达上下调分析 RS4;11 Exp. Jurkat Exp. GM Exp. mir-422a 8.27 mir-140-3p 8.57 mir-3927 1.64 mir-423-5p 6.98 mir-29c-3p 1.96 mir-320b 6.45 特异性高表达miRNA Lower expression RS4;11 Jurkat GM Higher expression RS4;11 72 90 Jurkat 72 110 GM 48 58 41 结果与讨论 —— 白血病调控网络 造血系统分化与白血病发生相关基因调控网络 42 细胞增殖、凋亡与白血病发生相关基因调控网络 结果与讨论 —— 调控网络预测1 ETS1 BMI1 RAB23 RAB9b MYB RELB IRF4 NFkB2 REL FLI1 cell cycle inhibitor cell death signal transduction regulation of hematopoiesis abnormal proliferation trigger apoptosis FOS MAFK cell survival and proliferation differentiation membrane trafficking differentiation proliferation and differentiation blood coagulation AP1 proliferation differentiation apoptosis 白血病发生 43 结果与讨论 —— 细胞分化调控网络 B 44 结果与讨论 —— 调控网络预测2 B细胞分化 Blimp-1 PAX5 PU.1 LEF1 ID2 NOTCH NOTCH1 NOTCH2 CD19 LMO2 ERG RUNX1 RUNX3 45 结果与讨论 —— 小结3 在三株淋巴系细胞中检测到约15%左右的已知miRNA表达，其中80%以上表现为低或极低表达，在三株细胞中均表达的miRNA有103个。 miRNA表达谱聚类结果与转录组一致，白血病细胞之间更为相似且拥有更多上调的miRNA。 造血系统分化及白血病发生的过程由多个miRNA同时调控，这些miRNA在特定时期的上、下调影响了转录表达谱的改变。 46 总结与展望 —— 总结 48 Summary Justin M. Longa, 2012 个体化医疗 核心实验室 疾病导向标志 (癌症，心脏病，……) 药物基因筛检 疾病风险评估. 预防医学 医师,病人,健康人 RD 治疗 1 2 3 4 5 (药物, 其他) CLIA认证 组织 DNA RNA, Others …… 生物标志 分子影像 其他检测方法 基因诊断与个体化医疗 Complexity DNA RNA Protein 高通量系统与癌症标记 AA BB AB Genome Epigenome Transcriptome methylation Expression genechip and microRNA array SNP, aCGH chips NGS Mass spectrometry Methylation chip Metabolyte Proteome Metabolomics New Generation Sequencing * 肺癌发展过程 与 癌症标记研发 Herbst RS, N Eng J Med 2008 Predisposition Cancer