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- 2019-08-30 发布于湖北
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* 第五章 药物发现的虚拟筛选方法 化学信息学 生物信息学 虚拟筛选 先导物 化学生物学 候选药物 靶点大分子 第一节 概述 虚拟筛选:针对重要疾病特定靶标生物大分子的三维结构或定量构效关系(QSAR)模型,从现有小分子数据库中,搜寻与靶标生物大分子结合或符合QSAR 模型的化合物,进行实验筛选研究。 虚拟筛选流程 基于分子对接虚拟筛选流程 SARS爆发,从现有药物中快速筛选,老药,安全,直接进临床。 SARS冠状病毒(SARS-CoV)蛋白水解酶(Mpro)的同源蛋白模拟结构; 虚拟筛选现有药物库MDL/CMC(/products/knowledge/medicinal_chem/index.jsp); 老药肉桂硫胺(抗精神分裂和抗炎):SARS-CoV Mpro 的抑制剂; (A) 肉桂硫胺的化学结构;(B) 肉桂硫胺与SARS-CoV Mpro活性位点的作用方式 (绿线:-NH?或-CH?氢键相互作用;红线:-CH?O 氢键相互作用;蓝线:C145 的巯基(-SH)与肉桂硫胺的C=C 双键作用 酶水平抑制活性IC50 为5.0μM,能抑制病毒颗粒的复制; 细胞水平抑制SARS-CoV 的活性为31μM;是冠状病毒Mpro 的专一性抑制剂。 第二节 化学信息处理 一、化学信息的表示方法 1、一维结构表示 SMILES编码的立体化学信息表示 第二节 化学信息处理 一、化学信息的表
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