分子标记讲义.pptVIP

SCAR的操作过程： RAPD标记技术分析； 回收特异RAPD扩增片段； RAPD产物克隆与测序； RAPD产物特异引物设计； 特异引物引导下的PCR反应； 电泳获得SCAR标记。 2.4 简单序列重复标记 （simple sequence repeat，SSR） 真核生物基因组含有分散重复序列和串连重复序列两种类型的重复序列。根据重复序列的长度、拷贝数和位置等又将串连重复序列分为卫星DNA（基序长100－300bp）、小卫星DNA （基序长10－60bp）、 微卫星DNA（基序长1－6bp，如 CA、 CTCG ）等几种类型。 SSR根据简单重复序列外两翼的特定短序列设计引物，用来扩增重复序列本身，由于重复的长度变化极大，所以会得到不同长度的片段。如果扩增出来的某个片段与某个特定性状存在对应关系，则该片段为该性状的SSR标记。 SSR原理 ? 重复单元： 1~ 6bp,如 CA, CTCG ? 重复次数：5~ 30 次 ? 覆盖长度：10~300 bp 特点： 数量多且平均分布； 位于内含子中； 共显现遗传； 结果重复