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二、配对设计均数比较的t检验（配对t检验） 配对设计处理分配方式主要有三种情况： ①两个同质受试对象分别接受两种处理，如把同窝、同性别和体重相近的动物配成一对，或把同性别和年龄相近的相同病情病人配成一对； ②同一受试对象或同一标本的两个部分，随机分配接受两种不同处理； ③自身对比(self-contrast)。即将同一受试对象处理（实验或治疗）前后的结果进行比较，如对高血压患者治疗前后、运动员体育运动前后的某一生理指标进行比较。 案例1 6L1 Tm1 t ratio Testing if pairs follow a Gaussian distribution 独立样本：又称非配对样本或成组样本。是指一组数据与另一组数据没有任何关系，也就是说，两样本资料是相互独立的。 两组的样本容量尽可能相同，可以提高检验的精确度。 其均数差异显著性的t检验，又分为两总体方差相等（方差齐性）和方差不等两种检验方法（Levene’s Test for equality of variance）。 若两总体方差不等,即方差不齐，可采用t’检验,或进行变量变换,或用秩和检验方法处理。 三、两个独立样本均数比较的t检验 （两独立样本的t检验） 案例2 6L1rs和16L1rs Tm1 nonparametric test Choosing when to use a nonparametric test is not straightforward The Mann-Whitney test Wilcoxon matched pairs test unpaired data 总结 应用条件： t 检验：1. 小样本（n＜50）计量资料 2.样本来自正态分布总体 3.总体标准差未知 4.两样本均数比较时，要求两样本相 应的总体方差相等（方差齐性） * 把所有观察值之间的变异分解为几个部分。即把描写观察值之间的变异的离均差平方和分解为某些因素的离均差平方和及随机抽样误差的离均差平方和，进而计算其相应的均方差，构成F统计量。 分类： 单因素方差分析：因素只有一个，这个因素的水平≥2。 多因素（≥2）方差分析：因素≥2，各因素的水平≥2 方差分析（ANOVA，F检验）和prism软件应用 在试验中所考虑的因素只有一个时，称为单因素实验。 它是最简单的一种，它适用于只研究一个试验因素的资料，目的在于正确判断该试验因素各处理的相对效果（各水平的优劣） 1.各样本是相互独立的随机样本； 2.各样本数据均服从正态分布； 3.相互比较的各样本的总体方差相等， 即方差齐性(homogeneity of variance)。 单因素方差分析（one way ANOVA） ordinary one-way ANOVA Repeated measures one-way ANOVA Non parameters :Kruskal-Wallis test; Fredman’s test 案例3 NaCl浓度对6L1rs颗粒影响 NaCl浓度对11L1rs颗粒影响 F ratio * 多因素方差分析（two way ANOVA） 总体思路： 1、观察数据类型选择方法 ——一般线性模型——多因素方差分析 2、选择要分析的结果变量，固定因素或随 机因素变量的选择。 3、方差分析模型的选择：全因素or自定义 4、选择描述性统计分析。 5、两两比较（多重比较）方法的选择。 案例4 HPV不同型别、25度不同天数的颗粒结果 线性回归和prism软件应用 The goal of linear regression is to adjust the values of slope and intercept to find the line that best predicts Y from X. r2, a measure of goodness-of-fit of linear regression The value r2 is a fraction between 0.0 and 1.0, and has no units An r2 value of ?0.0 means that knowing X does not help you predict Y. When r2 equals 1.0, all points lie exactly on a straight line with no scatter. Knowing X lets y