家畜育种学第4章 数量遗传学基础(2011).pptVIP

第四章 数量遗传学基础 第一节 数量性状的概念和特征 第二节 数量性状遗传的多基因假说 课堂练习 本世纪50年代初期，美国海福特牛中侏儒型个体较为普遍，它存在几种不同类型，其中最普遍的一类是由一个隐性基因决定的，设显性基因为A1，隐性基因为A2。据调查，美国海福特牛群体中A2的频率约为0.2，已知21月龄时侏儒型（A2A2）体重为172 kg，正常个体（A1A1）为381kg，假设A1对A2为完全显性。试计算：（1）A1、A2的平均效应；（2）群体均值；（3）各基因型的加性值；（4）显性离差。 （1）两种纯合体间差异为：381-172=209kg，则a=209/2=104.5kg，M=381-a=276.5kg，由于完全显性，则d=a=104.5kg。由公式可计算： A1平均效应a1=q(a+d(q-P))=0.2*(104.5+104.5*(0.2-0.8))=8.36kg A2平均效应a2=-p（a+d(q-p))=-33.44kg (2) 群体均值 P=p2a+2pqd+q2(-a)+M 或P=381*0.82+381*0.2*0.8*2+172*0.22=372.64kg （3） 加性值 A1A1 P+2a1=372.64+2*8.36=389.36kg A1A2 P+a1+a2=372.64+8.36-33.44=347.56kg A2A2 P+2a2=372.64-2*33.44=305.76kg （4）某基因型的显性离差即为：基因型值-加性值。是指由于显性所引起的基因型值偏离加性值的大小。 显性离差 A1A1 381-389.36=-8.36 A1A2 381-347.56=33.44 A2A2 172-305.76=-133.76 第三节 亲属间相关分析 第四节 数量性状参数分析 重复率的计算： MSB代表个体间均方，MSw代表个体内度量间均方，n为度量次数。如果每个个体度量次数不等，用n0代替n 计算步骤： 资料整理。 计算平方和、自由度、均方和n0： 计算re Φ Φ 一般情况 0 0 叔侄（父系） 0 0 祖孙（父系） 0 0 1 亲子（父系） 双重表兄妹 0 0 表兄妹（父系） 0 0 半同胞（父系） 全 同 胞 1 1 1 1 1 同卵双生 遗传相关 遗 传 协 方 差 Φ Φ 亲 属 表2.2 亲属间遗传协方差和近似遗传相关 定量描述数量性状遗传规律有三个最基本的遗传参数：重复力、遗传力和遗传相关 重复力（repeatability） 是衡量一个数量性状在同一个体多次度量值之间的相关程度的指标。 对性状的终身表现产生的影响有： 所有的基因效应 持久性环境效应 指时间上持久或空间上非局部效应的环境因素对个体性状表现所产生的影响。 暂时性环境效应 一些暂时的或局部的特殊环境因素对个体性状的某次度量值产生影响 重复力估计原理 从效应剖分看,可将环境效应（ ）剖分为持久性环境效应（ ） 暂时性环境效应（ ）两部分 ，因此 假定基因型效应、永久性环境效应和暂时性环境效应之间都不存在相关，可以将表型方差（ ）剖分为: 故重复力 可定义为: 重复率re≥0.60称为高的重复率；0.30≤re＜0.60称为中等重复率，而re＜0.30称为低的重复率。 重复力的作用 （1）重复力可用于验证遗传力估计的正确性(re大于h2) （2）重复力可用于确定性状需要度量的次数 假设一个个体度量了 次，用这些度量值的平均数作为该个体的平均表型值，记为 ,可以得到多次度量均值方差与单次度量值方差的关系为： 当度量次数无穷大时,多次度量可以提高度量准确性的极限值为 ,因此以它为基础,多次度量可以提高的度量准确性效率（Q）为: (2.14) (2.15) 图2.4 不同重复力时多次度量的相对准确度（ 图2.4 不同重复力时多次度量相对 准确度（Q）的变化曲线 （3）重复力可用于种畜育种值的估计 SSW=SST-SSS dfT=Σni-1=101-1=100 ， dfB=k-1 ，dfW=dfT-dfB MSB=SSB/dfB , MSW=SSW/dfW 或 遗传力 遗传力概念和估计原理 广义遗传力 指数量性状基因型方差占表型方差的比例，它反映了