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- 2020-04-02 发布于湖北
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大豆灰斑病种质资源的特异性指数 (SI)分析
作物种质资源是人类赖以生存的极为珍贵的农业遗产和自然资源,在农业生产上起着重要作用。作物种质资源对于现有品种的改良、选育适宜一定区域的推广品种以及具有专用价值的品种具有重要的意义。大豆起源于我国,有5000多年的栽培历史,经过长期自然和人工选择,积累了变异极为丰富的大豆种质资源。因此对大豆种质资源的分析与评价就显得非常重要。
在种质资源分析方面,从最初的表观性状鉴定、生理生化标记,到现在的分子标记(RAPD、RFLP、AFLP、SSR、SNP等等),分析手段日益深入,对资源的评价与分析更为准确。但在资源的评价方面,目前主要采用的是遗传相似系数或遗传距离。国内外研究者根据自己需要也提出了10多种相似系数算法,但这些算法只能对种质资源材料间的关系进行评价,而不能对资源材料本身的特征或特异性给出评价,为此提出特异性指数(Specialty Index,SI)。公式如下:CHEN Specialty Index(CHEN-SI)
CHEN-SIi =(∑(1 /(Nij / Mj)))(i =1,2,3...m; j=1,2,3...n)
m为材料总数;n为位点总数;CHEN-SIi 为第i份材料的特异性指数;Nij为第i份材料在j位点的等位基因类型在m个个体中的分布总数;Mj为第j位点存在的等位基因总数。Nij/Mj为第i份材
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