第三章-基因组的结构与功能学习资料.pptx

第三章 基因组的结构与功能问 题1. 什么是基因组？不同物种基因组的组成、结构和功能有何不同？2. 什么是基因组计划？基因组计划应用了哪些遗传学原理？3.后基因组时代的遗传研究方法和领域有哪些？4.讨论：4.1基因组信息是否应该公开？4.2你对基因组的起源和进化有何认识？ 基因组研究的关键问题是它到底含有多少基因。我们可以从4个水平来考察基因的总数目，而这4个水平对应于基因表达的4个连续过程：基因组（genome）转录组（transcriptome）蛋白质组（proteome）蛋白质组合体一基因组概念基因组概念基因组 genome真核生物中单倍体细胞中所含的整套染色体。一个物种的单倍体染色体组所含有的一整套基因。整套染色体所包含的DNA分子以及DNA分子所携带的全部遗传指令。基因组概念基因组 genome细胞中所有遗传物质（通常是DNA）的总和，包括基因序列和基因间序列。每种生物都携带特定的基因组序列，基因组包含了构成和维持该生物体生命形式与生命活动所需的全部遗传信息。DNA基因组 RNA基因组核基因组 线粒体基因组 叶绿体基因组 基因组学 genomics二病毒基因组病毒是非细胞型的微生物，结构简单，体积微小，只含有一种类型的核酸（DNA或RNA），缺乏完整的酶和能量系统，依靠自身的核酸指导和利用活细胞宿主的合成装置进行复制和表达。病毒基因组的大部分是用来编码蛋白质的，只有非常小的一份不被翻译 流感的启示……流行时间发源地流行病毒流行地区死亡人数 1918年-1919年美国/法国H1N1 三元重组病毒全球全球4000万-1亿 25%美国人感染1957年中国H2N2二元重组病毒 全球 全球100万（美国6.98万）1968年香港H3N2二元重组病毒全球美国3.38万SARS和甲型H1N1流行时间发源地流行病毒流行地区病死率2003年中国H5N1高致病性禽流感亚洲61%2009年北美H1N1三元重组病毒全球1.22% 两个问题：为什么如此猖狂和可怖的流感病毒不能像天花病毒一样被“消灭”？为什么不能通过接种疫苗进行有效的预防？ 为什么每一次大流行的流感病毒的类型都不一样？ 解答频繁爆发的流感流行流感病毒基因组— 结构RNA病毒，编码两类蛋白质：核蛋白（RNA聚合酶和核衣壳蛋白）和表面蛋白；按照核蛋白分类：甲、乙、丙型流感；按照表面蛋白分亚型（H N）： H为血凝素抗原(Haemagglutinin)，帮助病毒粘住和进入细胞，然后进行复制, H至少有15种亚型，其中H5和H7的致病性最高。N为神经氨酸抗原(Neuraminidase)，进入宿主细胞后控制细胞裂解，使病毒在宿主体内自由传播，有9种亚型。解答频繁爆发的流感流行流感病毒基因组— 变异1）基因重组 由于流感病毒的基因序列是以独立的片段存在于病毒体内，因此当不同病毒感染同一宿主细胞时，容易发生染色体的交换和重组，发生变异。（H1N1*H5N1;H1N1*H1N2）。2）抗原漂变 RNA病毒基因组中没有复制校正系统，因此基因组的突变压力较小，流感病毒随时有进一步突变的可能。流感病毒基因组测序的发现2009年3月起源于墨西哥和美国的甲型H1N1 流感，为A型流感病毒，属于H1N1亚型流感病毒毒株。 H1N1为单股RNA病毒，基因组13.6 kb，含8个独立的基因片段，分别编码RNA聚合酶PB1，聚合酶PA，PB1-F2和PB2，基质蛋白M1和M2，非结构蛋白NS1和2，核衣壳蛋白NP，凝血酶素HA和神经氨酸NA。基因重组PB1来自人的H3N2PB2和PA来自于禽的H5N1新H1N1毒株HA,NP和NS来自北美猪的H1N1；NA和MP来自欧洲猪的H1N1 认识病毒基因组的重大意义１）临床疫情诊断２）分子流行病学研究３）合理科学的防治监控４）制备有效的抗病毒疫苗 病毒基因组6类：双链DNA病毒基因组单链DNA病毒基因组正链RNA病毒基因组负链RNA病毒基因组双链RNA病毒基因组反转录病毒基因组病毒基因组－1双链DNA病毒基因组双链线状：疱疹病毒，痘病毒，虹彩病毒，腺病毒特殊结构：疱疹病毒，虹彩病毒有末端冗余序列，可自5’端外切，产生粘末端并形成环状；腺病毒有末端反向重复序列，可形成柄环状分子。复制表达：利用宿主核内依赖DNA的RNA聚合酶转录早期mRNA；再在细胞质的核糖体上翻译早期蛋白，以合成子代DNA分子；以子代DNA分子为模板，转录晚期mRNA；再在核糖体上翻译病毒结构蛋白。（半保留复制）病毒基因组－2单链DNA病毒基因组动物DNA病毒中的细小病毒科特殊结构：5’端和3 ’端均有回文序列，可形成发夹结构；能产生两种不同极性的单链DNA，或正或负的同种病毒能够退火形成双链DNA。复制表达：依赖宿主DNA聚合酶。如： Φχ174噬菌体Φχ174是一种小噬菌体，含