现代分子生物学-DNA.pptVIP

* * 现代分子生物学 Current Molecular Biology 章晓波 浙江大学生命科学学院 考查： 撰写1篇分子生物学相关文献综述 write a review paper related to molecular biology DNA研究进展-简介 Progress in DNA research 一、表观遗传学 二、DNA修复 三、基因序列多样性 表观遗传学（epigenomics）：基因序列不改变，可遗传的表型变化 一、表观遗传学 epigenomics 染色质重塑复合物：依靠水解ATP提供能量来完成染色质结构的改变， 根据水解ATP的亚基不同，可将复合物分为SWI/SNF复合物、ISW 复合物以及其它类型的复合物。这些复合物及相关的蛋白均与转 录的激活和抑制、DNA的甲基化、DNA修复及细胞周期相关。 DNA甲基化（ DNA methylation ）： 在DNA甲基化转移酶的作用下，主要是基因组CpG二核苷 酸的胞嘧啶5’碳位共价键结合一个甲基基团 DNA复制相关--组蛋白修饰(DNA replication--histone) 乙酰化、去乙酰化（acelation/deacelation）：乙酰化转移酶(HATs) 主要在组蛋白H3、H4的N端尾上的赖氨酸加上乙酰基，去乙酰化 酶(HDACs)相反 磷酸化、去磷酸化（phosporylation/dephosporylation） 甲基化（methylation）：组蛋白甲基化主要发生在H3和H4组蛋白N端 Arg或Lys残基上，功能主要体现在异染色质形成、基因印记、X染 色体失活和转录调控方面 基因组印记（ genomic impriting ）： 来自父方和母方的等位基因在通过精子和卵子传递给子 代时发生了修饰，使带有亲代印记的等位基因具有不同 的表达特性，这种修饰常为DNA甲基化修饰，也包括组 蛋白乙酰化、甲基化等修饰 X染色体失活（X chromosome inactivation ） 　　女性有两条X染色体，男性只有一条X染色体，为保持平衡，女 性的一条X染色体被永久失活，即“剂量补偿”效应 父本X染色体在所有的早期胚胎细胞中失活，表现为整个染色体 的组蛋白被修饰和对细胞分裂有抑制作用的Pc-G蛋白(Polycomb group proteins, Pc-G)表达，然后Xp在内细胞群又选择性恢复活性， 最后父本或母本X染色体再随机失活。 功能性非编码RNA（non-coding RNA）： 长链非编码RNA（long strain non-coding RNA）：在基因簇以至 于整个染色体水平发挥顺式调节作用，还具有反式调节的 作用 短链RNA（short strain non-coding RNA）：在基因组水平对基 因表达进行调控 DNA骨架的硫修饰（sulfur modification of DNA backbone）： 从植物致病菌到人类病原菌，从好氧菌到厌氧菌，广泛多样性 硫修饰是自然微生物DNA骨架广泛存在又非常独特的生理修饰 DNA硫修饰微生物的分布与特定的海洋区域、海洋深度相关 二、DNA修复（DNA repairing） DNA修复：细胞对内外诱变因素造成的DNA损伤和复制过程中发生 非标准碱基的参入，以及碱基错配所造成的DNA结构和 序列错误的一种纠正功能和过程 所有细胞都具有特定的DNA修复酶系统以确保遗传信息的正常流动 DNA损伤原因（DNA damage results from） DNA损伤类型（types of DNA damage） DNA修复机制（mechanism of DNA repair） 直接修复 (direct repair) 切除修复(excision repair) 错配修复(mismatch repair) 识别出正确的链（母链甲基化），切除掉不正确的部分，然后通过 DNA聚合酶和DNA连接酶，合成正确配对的双链DNA 主要用来纠正DNA双螺旋上错配的碱基对，还能 修复一些因复制打滑而产生的小于4nt的核苷酸 插入或缺失 双链断裂修复(double strain break repair) 在DNA损伤时，缺乏校对功能的DNA聚合酶常在受损部位进行DNA 复制以避免细胞死亡，但同时又导致较高的差错率的修复方式 由高水