生物信息学 NCBI数据库.pptVIP

2.比对结果描述 与目标序列同源性最高的结果在最上面，E值最低，score最大，点击序列号可以查看详细信息。点击score可以打开对应的比对详细信息。 转录产物序列 基因序列 匹配序列表 带有genbank的链接，点击可以进入相应的genbank序列 目标序列描述部分 匹配情况，分值，e值 Blast程序评价序列相似性的两个数据 Score：使用打分矩阵对匹配的片段进行打分，这是对各对氨基酸残基（或碱基）打分求和的结果，一般来说，匹配片段越长、 相似性越高则Score值越大。 E value:在相同长度的情况下，两个氨基酸残基（或碱基）随机排列的序列进行打分，得到上述Score值的概率的大小。E值越小表示随机情况下得到该Score值的可能性越低。 3、各序列比对详情 因申请者提交的要求不同，行列输出有不同的形式，系统默认的是配对行列输出，即查询序列与数据库中匹配的序列垂直对应。空位部分代表查询序列与检索匹配序列不一致。 双序列比对 Blast比对后，当在数据库中搜索到多个显著相似的序列时，目的序列是否与数据库中检索到的序列真正有关联，这时就需要进行双序列比对（pairwise alignment）。 通过双序列比对分析，可以找出两序列之间的最大相似性匹配，进而判断两者是否具有同源性。 Blast主页 双序列比对 Thank you and qu