第二章菌物分类学.pptVIP

（1）rRNA具有重要且恒定的生理功能； （2）在16S rRNA分子中，含有高度保守的序列区域、中度保守和高度变化的序列区域，适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究； （3）16S rRNA分子量大小适中，便于序列分析； 16S rRNA  ——“分子尺”或“分子计时器” （4）rRNA在细胞中含量大(约占细胞中RNA的90%)，也易于提取； （5）16S rRNA普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同源分子是18SrRNA)，可以作为测量各类生物进化的工具。 16S rRNA  ——“分子尺”或“分子计时器” 16s rRNA核苷酸序列分析步骤 提取DNA ↓ PCR扩增16S rRNA基因 ↓ PCR产物纯化 ↓ 16SrRNA基因序列测定 ↓ Genbank检索 相似性结果的一般判断： SAB≥97% 同种 SAB为85-97% 同属 SAB≤85 % 不同属 概括各种生物间亲缘关系的树状分枝图，分无根树和有根树 系统发育树（phylogenetic tree） 微生物的系统树 细菌（Bacteria） 古生菌（Archaea） 真核生物（Eukarya） 4. 微生物全基因组序列的测定 1996年，在633位科学家通力合作下，第一个真核生物酿酒酵母基因组测序完成。 2002年粟酒裂殖酵母基因组测序完成。 2003年，第一个丝状真菌粗糙脉胞菌基因组测序完成。 到2008年，在NCBI和其他网站已公布了80种真菌的基因组序列。 （二）细胞化学成分用作鉴定指标 细胞壁的化学成份 全细胞水解液的糖型 磷酸类脂成分的分析 枝菌酸的分析 醌类的分析 气相色谱技术用于微生物鉴定 * * * * * * * 第二章 菌物分类学 * 菌物分类学：在分类的基础上，对种类繁多的真菌进行系统的归纳和整理，并建立起一定的分类体系，使之能全面反映各分类单元之间的相互关系。 一、真菌分类的目的 根据国际上已经承认的一些分类系统给每一种真菌命名，以便交流有关真菌的各方面的知识；指出已知菌种之间的亲缘关系，因为亲缘关系相近的种其生物学特性也相似。 二、真菌分类的基本规则 (一)分类等级：真菌的分类等级依次为界、门、纲、目、科、属、种。 （二）基本分类单位——种 1、形态学种：根据形态特征的不连续性，对真菌个体进行分类而区分的类群。 2、生物学种：指原本可以相互交配繁殖，但由于地理隔离或生殖隔离，彼此没有机会交配的一个自然种群或个体种群 3、系统发育种：经过系统发育分析而确定的具有同一个系谱关系的个体类群 * 原核生物界 原生生物界 植物界 菌物界 动物界 粘菌门 真菌门 ⑴ 林奈（Linnaeus）（1753）: 两界系统 动物界 植物界 ⑵ Whittaker（1969）: 五界系统 有人提出设立另一个界：病毒界 （一）两界系统 （二）三界系统 （三）四界系统 （四）五界系统 （五）六界系统 （六）三总界五界系统 一、生物的界级分类学说 第二节 真菌在生物中的分类地位 生物界级学说发展的示意图 两界系统 1753年，瑞典博物学家林奈（Carl vov Linne）在其名著《植物种志》首先提出。 动物界 植物界 三界系统 1939年，Conard提出菌物界； 1860年，Hogg提出设立原始生物界； 1971年，Dodson提出菌界； 1866年，德国动物学家E.H.Haeckel建议三界系统。 动物界 植物界 原生生物界 四界系统 1938年，Copeland提出四界系统，1956年成熟； 1959年，Whittaker提出菌物界和原生生物界； 1974年，Leedale提出真菌界和原核生物界。 动物界 植物界 原始生物界 菌界 五界系统 1969年，R.H.Whittaker在Sci