class9DMol3离域内坐标法进行几何优化.pptVIP

* 使用DMol3 中的离域内坐标对固体进行几何优化 DMol3 的面向分子的离域内坐标优化机制为大分子系统提供了一套良好的方案。在MS Modeling 的DMol3 中，这个机制被扩展到周期性系统。 这个基于离域内坐坐标的新型优化工具还有能力处理以下体系： ?? * 高配位体系，比如密堆积固体。 ?? * 片断系统，比如分子晶体，其中的内坐标并不是遍及整个优化空间。 ?? * 优化过程中，部分进行了的迪卡尔坐标限制的体系。 自身效率工作表明，对周期性体系而言，这个艺术级(state-of-the-art)的离域内坐标优化方案的效率要比迪卡尔坐标方法高出2-5 倍，而迪卡尔坐标方法是现在进行固态计算的标准方法。 在这部分讲义中，将介绍如何利用DMol3 的的离域内坐标方法，对沸石结构进行几何优化。内容 ?? 1. 开始－建立名为chabazite的Project，输入沸石结构 2. 建立DMol3计算任务 ?? 3.控制工作设置和运行计算任务 ?? 4.使用服务器控制台控制计算任务 ?? 5.检验计算结果 目的：介绍volume visualization工具和离域内坐标在周期体系中的应用模块： Materials Visualizer, DMol3前提： 简单分子的绘制，用DMol3计算带结构和态密度 1. 开始－建立名为chabazite的Proje