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生物多样性基础研究 ——基本理论和方法 制作者：张倩 沈玲 孙骋 内容提要 一、概念 二、原理和方法进展 三、研究原理和方法中存在的问题 四、发展趋势 一、生物多样性概念 生物多样性（Biological Deversity）是指生物和它们组成的系统的总体多样性和变异性（1995年，联合国环境规划署在《全球生物多样性评估》中定义） 包括：遗传多样性 物种多样性 生态系统多样性 二、原理和方法进展 1、遗传多样性（genetic diversity ） 概念：种内不同种群之间或同一种群内不同个体的遗传变异总和。 目前遗传多样性的评价指标： ⑴杂合度和基因多样度用 ⑵遗传距离 ⑶核苷酸多样性 ⑷固定系数 ⑸共享带率 分子水平检测遗传多样性的方法： ⑴同工酶电泳 ⑵DNA限制性酶切长度多态性 ⑶DNA指纹谱 ⑷建立在PCR基础上的DNA多态性检测 ⑸DNA序列分析 ⑹DNA标记片段的选择 2、物种多样性 概念：一定时间一定空间中全部生物或某一生物类群的物种数目与各个物种的个体分布特点。 物种多样性包括两个方面： ⑴一定区域内物种的丰富程度，可称为区域物种多样性； ⑵生态学方面的物种分布的均匀程度，可称为生态多样性或群落多样性。 物种多样性研究的现状 物种多样性研究以系统学为基础，探讨物种多样性的空间格局、时间格局和生物学格局，从进化与系统发育的角度认识物种多样性的产生与发展历史。 物种多样性研究的主要内容集中在物种多样性的现状(包括受威胁现状)、物种多样性的形成、演化及维持机制等方面。 评价指标和数量模型 生物多样性的评价是有效保护生物多样性、合理利用其资源、保护其可持续发展的关键。 有关生物多样性的研究在不断深入，从定性研究逐步走向定量，用10多种度量群落物种多样性的指标和数量模型，如多种丰富度指数、多样性指数、均匀度指数等。这些指数模型，多数以概率论和信息论为基础，用来度量群落中和物种数、总个体数和各种的多度均匀性的综合指标。 物种多样性指数是将物种丰富度与种的多度结合起来的函数。常用的有Shannon—wiener指数，Simpson指数以及种间相遇几率等。应用多样性指数时，具低丰富度和高均匀度的生态系统和具高丰富度和低均匀度的生态系统可能得到相同的多样性指数。 物种多样性指数 物种多样性指数是将物种丰富度与种的多度结合起来的函数。常用的有Shannon—wiener指数，Simpson指数以及种间相遇几率等。应用多样性指数时，具低丰富度和高均匀度的生态系统和具高丰富度和低均匀度的生态系统可能得到相同的多样性指数。 Simpson指数 Simpson指数是从概率论导出的方法而得。假设从包含N个个体得S个种得集合(其中第i种有Ⅳf个个体，i=1，2，?，s)中，随机抽取两个个体并不再放回。如果这两个个体属于相同种得概率大，则此集合得多样性低。令P，表示整个生态系统总体中第i种个体的比例，那么，随机抽取两个个体同属i种的联合概率是： 如果总合生态系统中s个种的全部概率，就得到Simpson指数： 因为对生态系统不可能总是作完全面积的调查，所以上面假设的集合只能是一个随机样本，而P，的真值也是未知的，只能由随机样本得到其最大似然估计量 由此可得： 物种丰富度指标 此指标测定一定空间范围内的物种数目以表达生物的丰富程度，主要有一定样地内的物种数(s)，Margalef指数、Gleason指数。 式中，Ⅳ为个体总数；S为生态系统中物种数目。 均匀度指数 均匀度指数是把物种丰富度与均匀结合起来的一个的统计量，应用最多的是Pielous均匀度指数(群落的实测多样性与最大多样性之比率)、Alatalo均匀度指数(对样本大小不敏感的均匀度指数)。 H为实际观察的种类多样性，为最大的种类多样性。 物种不均匀度（R）的衡量： 森林物种多样性指标和指数 对森林物种多样性的描述，要区别阔叶林与针叶林。一般阔叶林中物种的丰富程度超过针叶林的丰富程度。使用PRS 评价方法，多采用阔叶林的面积和阔叶林的蓄积、森林失火面积、森林火灾面积和使用化学药剂除叶面积等相应指标描述森林生物多样性的物种丰富程度。森林物种多样性随着阔叶林面积指数（I8）、阔叶林蓄积指数（I9）的增加而增加，因此，阔叶林面积、阔叶林蓄积为正向指标；但森林生物多样性一般随着森林火灾面积指数（I10）、森林失火面积指数（I11）、使用