第二章 蛋白质(2).pptVIP

* * 对于较大的蛋白质分子或亚基（subunit），多肽链通常由两个或两个以上相对独立的结构域缔合成三级结构；对于较小的蛋白质或亚基，结构域和三级结构是等同的，即这些蛋白质是单结构域的。 三级结构的局部折叠区，一条多肽链在这个域范围内来回折叠，但相邻的域常被一个或两个多肽片段连结。 * * 丙糖磷酸异构酶和丙酮酸激酶的β-圆桶结构域 * * 肌红蛋白和血红蛋白β-亚基 * * 为什么要形成结构域？ 动力学：一条长的多肽链先折叠成几个相对独立的区域，再缔合成三级结构要比直接折叠成三级结构更合理。 功能：酶蛋白的活性中心往往位于结构域之间，因为连接各个结构域的常常是一条松散的肽链，使结构域在空间上摆动比较自由，容易形成适合底物结合的空间。 * * 4）蛋白质的三级结构（主要针对球状蛋白质分子） 蛋白质的三级结构(Tertiary Structure)是指在二级结构、超二级结构和结构域等结构层次的基础上，组装而成的完整的结构单元。即多肽链上包括主链和侧链在内的所有原子在三维空间内的分布。如果蛋白质分子仅由一条多肽链组成，三级结构就是它的最高结构层次 维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、离子键和范德华力等。尤其是疏水相互作用，在蛋白质三级结构中起着重要作用。 * * 疏水作用 * * 由153个Aa残基和血红素辅基组成的一条肽链。 有8段α-螺旋体。 内部疏水，外部亲水。 只有一个结构域。 肌红蛋白 * * 5）蛋白质的四级结构 两条及以上相互关联的具有独立三级结构的亚单位通过非共价键聚合而形成的特定构象。（每一个亚单位称为一个亚基，可以有一条或多条肽链） 包括各亚基的种类、数量及相互关系 寡聚蛋白：由多个亚基聚集而成的蛋白质。 亚基（subunit）：大多数相对分子量大的蛋白质都是由几个多肽链组成一个活性单位。这些肽链相互以非共价键联结成一个相当稳定的单位，这种肽链就称为该蛋白质的亚基。 亚基单独存在，无生物活性或活性很小，只有聚合成四级结构时才具有完整的生物活性 * * 血红蛋白由2条α和2条β共4个亚基组成。 α 和β链的一级结构差异很大，但三级结构基本相同，与肌红蛋白很相似。 四级结构由分子表面的次级键（盐键和H键）结合而成。 相同亚基的缔合称同多聚，不同亚基的缔合称杂多聚 一个蛋白质中的不同亚基通常以α、 β、r等命名 * * 血红蛋白（hemoglobin）的四个亚基 蛋白质四级结构的生物学意义： 增强结构稳定性； 形成新的功能部位； 对病毒可以提高遗传物质的利用效率。 * * 3、蛋白质的一级结构与高级结构之间的关系 高级结构在一级结构的基础上形成； α-螺旋的形成及稳定性取决于它的氨基酸组成和排列顺序，多肽链只要存在脯氨酸， α-螺旋即发生中断； 有可能以蛋白质的一级结构为基础，预测它的高级结构，预测方法主要是：物理化学计算方法和概率统计学方法； 目前能够预测的主要是二级结构，对三级、四级结构还无法预测。 * * * * 4、维系蛋白质结构所需要的作用力 维系蛋白质分子的一级结构：肽键、二硫键 维系蛋白质分子的二级结构：氢键 维系蛋白质分子的三级结构：疏水相互作用力、氢键、范德华力、盐键 维系蛋白质分子的四级结构：范德华力、盐键 a盐键（离子键 ） b氢键 c疏水相互作用力 d 范德华力 e二硫键 f 酯键 * * 氢键、范德华力、疏水相互作用力、盐键，均为次级键 氢键、范德华力虽然键能小，但数量大 疏水相互作用力对维持三级结构特别重要 盐键又称盐桥或离子键，它是正电荷与负电荷之间的一种静电相互作用（数量小）。 二硫键对稳定蛋白质构象很重要，二硫键越多，蛋白质分子构象越稳定 离子键 氢键 范德华力 疏水相互作用力 盐键 酸性氨基酸残基侧链电离后带负电荷 2.5蛋白质结构与功能关系 1、一级结构与功能关系 （1）种属差异 不同有机体中执行同一功能的蛋白质的氨基酸排列顺序存在十分明显的种属差异。 例1 胰岛素 来自哺乳动物、鸟类和鱼类的胰岛素一级结构都是由51个氨基酸组成，但排列顺序有的差异。 主要差异在A链小环的8、9、10和B链30位氨基酸残基。这4个氨基酸的改变不影响胰岛素的功能，但所有来源的胰岛素中二硫键的位置是固定不变的，说明其对胰岛素的功能十分重要。 表1-5 不同哺乳动物的胰岛素分子中的氨基酸差异 例2 细胞色素C（cytC） 广泛存在于需氧生物细胞的线粒体（mitochondrion）中，是一种与血红素辅基相结合的单链蛋白质，在生物氧化中起重要作用。 亲缘关系越近cytC组成和结构的相似性越大，从而为生物的进化提供了证据。 与功能密切相关的氨基酸序列是不变的。 表1-6 不同生物与人的细胞色素c相比