化合物脂水分配系数计算软件及比较研究-中国药科大学学报！.pdf

学 报 １７８ ＪｏｕｒｎａｌｏｆＣｈｉｎａＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ　２００８，３９（２）：１７８－１８２ 化合物脂水分配系数计算软件及比较研究  苏　笠，杨　劲 ，王友群，王广基 （中国药科大学药物代谢与动力学研究中心，南京２１０００９） 摘　要　目的：介绍几种常用的化合物脂水分配系数计算软件，并比较它们的准确度和适用范围等。方法：从分子结 构出发，运用ＣＬＯＧＰ、ＡＣＤ／ＬｏｇＰ、Ｐａｌｌａｓ和Ｍｏｌｉｎｓｐｉｒａｔｉｏｎ４种计算软件获得ｌｏｇＰ值，比较其计算准确度。结果：本文选择的 ４种计算软件均能比较准确的计算出化合物的ｌｏｇＰ值。结论：运用软件计算的方法得到大批量化合物的ｌｏｇＰ值，有助于 计算机辅助药物设计。 关键词　定量构效关系；计算机辅助药物设计；脂水分配系数；分子结构；ＣＬＯＧＰ；Ｐａｌｌａｓ；ＡＣＤ／ＬｏｇＰ；Ｍｏｌｉｎｓｐｉｒａｔｉｏｎ 中图分类号　Ｒ９１１　　文献标识码　Ａ　　文章编号　１０００－５０４８（２００８）０２－０１７８－０５ Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎａｎｄｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｏｆｓｏｆｔｗａｒｅｓｕｓｅｄｉｎｃａｌｃｕｌａｔｉｎｇｌｉｐｉｄ／ｗａｔｅｒ ｐａｒｔｉｔｉｏｎｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔｏｆｃｏｍｐｏｕｎｄｓ  ＳＵＬｉ牞ＹＡＮＧＪｉｎ牞ＷＡＮＧＹｏｕｑｕｎ牞ＷＡＮＧＧｕａｎｇｊｉ ＣｅｎｔｅｒｏｆＰｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓａｎｄＤｒｕｇＭｅｔａｂｏｌｉｓｍ牞ＣｈｉｎａＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ牞Ｎａｎｊｉｎｇ２１０００９牞Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ　Ａｉｍ牶Ｔｏｉｎｔｒｏｄｕｃｅｔｈｅａｖａｉｌａｂｌｅｓｏｆｔｗａｒｅｓｕｓｅｄｔｏｃａｌｃｕｌａｔｅｔｈｅｌｉｐｉｄ／ｗａｔｅｒｐａｒｔｉｔｉｏｎｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔｓｏｆ ｃｏｍｐｏｕｎｄｓａｎｄｔｏｃｏｍｐａｒｅｔｈｅｅｓｔｉｍａｔｉｏｎａｃｃｕｒａｃｙ．Ｍｅｔｈｏｄｓ牶Ｂａｓｅｄｏｎｔｈｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓｓｅｌｅｃｔｅｄ牞ｔｈｅ ｖａｌｕｅｓｏｆｌｏｇＰｗｅｒｅｃａｌｃｕｌａｔｅｄｕｓｉｎｇｓｏｆｔｗａｒｅｓＣＬＯＧＰ牞Ｐａｌｌａｓ牞ＡＣＤ／ＬｏｇＰａｎｄＭｏｌｉｎｓｐｉｒａｔｉｏｎ牞ａｎｄｔｈｅｅｓｔｉｍａ ｔｉｏｎａｃｃｕｒａｃｙｗａｓａｓｓｅｓｓｅｄｏｎｅｂｙｏｎｅ．Ｒｅｓｕｌｔｓ牶Ｔｈｅｆｏｕｒｓｏｆｔｗａｒｅｓｃｏｕｌｄａｃｃｕｒａｔｅｌｙｃａｌｃｕｌａｔｅｔｈｅｖａｌｕｅｓｏｆｌｏｇ Ｐ．Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ牶ＡｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆｔｈｅｓｅｓｏｆｔｗａｒｅｓｉｎｔｈｅｃａｌｃｕｌａｔｉｏｎｏｆｌｏｇＰｖａｌｕｅｓｏｆｃｏｍｐｏｕｎｄｓｆａｃｉｌｉｔａｔｅｓ ｃｏｍｐｕｔｅｒａｉｄｅｄｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ． Ｋｅｙｗｏｒｄｓ　ＱＳＡＲ牷ｃｏｍｐｕｔｅｒａｉｄｅｄｄｒｕｇｄｅｓｉｇｎ牷ｌｉｐｉｄ／ｗａｔｅｒｐａｒｔｉｔｉｏｎｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ牷ｍｏｌｅｃｕｌａｒｓｔｒｕｃｔｕｒｅ牷ＣＬＯＧＰ牷 Ｐａｌｌａｓ牷ＡＣＤ／ＬｏｇＰ牷Ｍｏｌｉｎｓｐｉｒａｔｉｏｎ 　　脂水分配系数（ｌｏｇＰ）是用来表示化合物的亲 １　基础与原理 脂性、透过生物膜的性能及与受体（包括酶）间疏 水性结合力的一种参数。疏水性影响药物吸收、生 脂水分配系数（ｌｏｇＰ）为化合物在非水相中的 物活性、疏水性药物受体相互作用、分子代谢变化 平衡浓度与其在水相中的中性形式平衡浓度的比 ［１，２］ 毒性等，在定量构效关系的研究中很重要 。新 值的对数，公式表达如下： 药开发过程中，可以所得定量构效和构动相关式为 ｌｏｇＰ＝ｌｏｇ（ｃ／ｃ） ｏ ｗ 基础，设计生物活性好并具有良好药动学参数的化