高性能计算在基础科学研究中的应用.PDFVIP

e-Science 论坛 PERSPECTIVE 年 月 科研信息化技术与应用 第2卷第4期 2011 7 高性能计算在基础科学研究中的应用 王普勇，王涛 上海超级计算中心，上海 201203 摘 要： 基础科学研究是高性能计算最主要的应用领域之一。本文基于上海超级计算 中心在科学计算方面的实践，介绍了高性能计算在计算化学、固体物理和纳 米材料、计算生物学和药物设计、天文物理等几个主要领域方面的应用，并 对其应用特点进行了分析。 关键词： 高性能计算；基础科学；应用 Application of High Performance Computing in Basic Scientific Research Wang Puyong, Wang Tao Shanghai Supercomputer Center, Shanghai 201203, China Abstract: Basic scientific research is one of the most important application field of High Performance Computing (HPC). Based on the practices of HPC in Shanghai Supercomputer Center (SSC), this paper introduces applications of HPC in differently basic scientific research fields such as computational chemistry, solid state physics and nano materials, computational biology and drug design, and astrophysics, etc.. Characteristics of these applications are also analyzed. Keywords: High performance computing; Basic scientific research; Application 14 年 月 PERSPECTIVE e-Science 论坛 科研信息化技术与应用 第2卷第4期 2011 7 1. 引言 规模的微观系统、越来越长时间的微观过程、越来 越精细的微观现象，从而极大的增强了对自然的认 理论推导和科学实验长期以来一直是人们研究 知能力。 和探索自然的两大方法，但随着高性能计算技术和 本文基于上海超级计算中心在科学计算方面 应用的迅猛发展，计算模拟已成为科学研究中不可 的实践，介绍了高性能计算在计算化学、固体物 缺少的第三种方法。高性能计算在基础科学研究、 理和纳米材料、计算生物学和药物设计、天文物 工业工程、公益事业、国防安全等各个领域的广泛