宏基因组学在基因发现中的应用.pptVIP

宏基因组学在基因发现中的应用 一、宏基因组学简介 宏基因组学（Metagenomics）又叫微生物环境基因组学、元基因组学 其主要含义是：对特定环境中全部微生物的总DNA（也称宏基因组，metagenomic）进行克隆，并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质；或者根据rDNA数据库设计引物，通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息 为什么要研究宏基因组学？ 在自然条件下,微生物广泛参与Ｃ、Ｎ、Ｏ和Ｓ等重要元素的循环转化,并在人体的食物消化、毒素降解及机体免疫反应、环境污染物降解等方面发挥着重要作用 微生物通过其群落而非单一个体来执行这些重要功能,而目前人们对微生物的认识主要基于实验室纯培养的单一微生物物种,对微生物群落作为整体的功能的认识远远落后于对其个体的认识 二、研究方法及应用 研究方法以基因组测序技术为依托 主要程序： 1、从环境样品 (例如土壤 )中直接提取 DNA; 2、将 DNA克隆到合适的载体中; 3、将载体转化到宿主细菌建立环境基因组文库; 4、对得到的环境基因组文库进行分析和筛选 宏基因组学的应用： 三、在基因发现过程中的应用 宏基因组文库的筛选方法是新基因发现的一种新策略 基因组文库的构建是揭示新基因的前提，如何有效地利用文库中丰富的资源,挖掘新的生物分子是关键 由于环境基因组的高度复杂性,需要通过高通量和高灵