第二章DNA、杀色体与基因组.ppt

§2-1 DNA超螺旋与拓扑异构现象 ;Superhelix of SV40 DNA (Vinograd, 1965);DNA超螺旋结构;超 螺 旋 形 成 示 意;二、 DNA超螺旋的方向性;拓扑学(topology)是研究几何图形在平面位置关系不变情况下空间结构变化规律的数学分支。;超螺旋发生的规律;l B-DNA是力学上稳定的结构（ 10 bp/ helix）;2．比连系差（Specific linking difference）σ;DNA分子形成超螺旋的生物学意义： 1．? 超螺旋DNA具有更紧密地形状，因此在DNA组装中具有重要作用； 2．? DNA的结构具有动态性，DNA超螺旋程度的改变介导了这种结构的变化，这有利于其功能??发挥。 3．? DNA是一种热力学上的稳定结构，超螺旋的引入提高了他的能量水平。 ;拓扑异构体(topoisomer)：具有不同连接数的同一种DNA分子称为DNA拓扑异构体。;Ⅱ型酶在两条单链上都产生切口，每次作用使连接数改变2。在Ⅱ型酶的作用是增加负超螺旋数，或减少正超螺旋数，在真核生物中还有减少负超螺旋的作用。 ;Top I (swivelase, niking-closing enzyme);图3.30 Ⅰ型拓扑异构酶作用机理;Top II (gyrase) ATP needed;Function Mechanism of Topoisomerase II ;§2-2 基因和基因组;指DNA分子所携带遗传信息总和，即指一个细胞所有基因和基因间DNA的总和，称基因组。遗传学定义为：一个物种的单倍体的染色体的数目为该物种的基因组。;霉菌;真核生物 DNA 染色体数 （2C） （2N） 两栖鲵 168.0 pg 24 肺鱼 100 38 蝾螈 85.3 24 警蛙 28.2 24 牛 6.4 60 人 6.4 46 绵羊 5.7 54 果蝇 0.2 8 贝母 196.7 24 豌豆 28 12 玉米 11 20;三、基因组的复性动力学;复性发生的过程的讨论; dCt / dt = -KCt2 积分 ;0;;Eukaryotic genomes have several sequence components;⑷变性程度 部分变性的DNA可直接通过拉链作用迅速复性，而完全变性的DNA一般需要几个小时才能复性。 ;3.高度重复序列（Highly repetitive sequence）;;基因家族：真核生物基因组中有许多来源相同、结构相似、功能相关的基因，这样一组基因称为基因家族。;;§2-3染色体;§2-3染色体;3.构成： 每个核小体含8个组蛋白；200bp DNA中，146bp 紧紧缠绕着组蛋白，其余用于连接两个核小体，称为连接DNA（linker DNA）。H1通常和连接DNA相结合，把核小体“封锁”起来。;4. 核小体包装的高级形式;;;（1）核小体（压缩比为7，200bp长为68nm，压缩后为10nm ） （2）30nm的核小体纤维（30nm fiber，压缩比为40）。（3）染色体DNA的某一部分和“核骨架”（nuclear scaffold）相连，把染色体DNA隔成许多含20000至100000碱基对的DNA环。 （4）约6个环与核骨架形成一个梅花结，每30个梅花结形成一盘。一条染色单体大约有10盘。;染色体模型基于的原理： 真核染色体DNA包装好象是一次缠绕再接一次更高级的缠绕。即在螺旋上形成螺旋，再形成螺旋。;名词解释 DNA的拓扑异构体，DNA拓扑异构酶，基因，基因组，C值，C值悖理，卫星DNA，基因家族，断裂基因，内含子，外显子，假基因，核小体 判断： 1.DNA拓扑异构酶Ⅰ能够切开DNA的1条链，而DNA拓扑异构酶Ⅱ能同时切开D