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EasyModeller 4.0 使用说明
----By Xm
中科院昆明动物研究所
2014.3.11
Before using
需要安装的软件:
Python(2.5,2.6,2.7系列均可,3系列不可)
Modeller()
Easymodeller 4.0
RasMol (windows版 )
Office Excel
*以上软件都能在官网或网站上下载,软件需要安装在C盘默认路径下,easymodeller 需安装在modeller目录下,所有安装路径中都不要出现中文!!
同源建模的基本步骤
1、模板蛋白搜索:
PDB数据库、BLAST(或PSI-BLAST) 、获取模板(一个或多个)
2、比对结果的校正
3、主链生成
4、环区建模
5、模型优化
6、合理性检测
模板.pdb文件准备
选择align结果中的蛋白,就可以找到相应的蛋白3D结构,下载pdb文件即可
Start using
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