酶学基础概论.pptVIP

* * E5-24 活性區 中催化區與專一性辨認區的模型，請注意所辨認的胺基酸基團，是在胜肽鍵 N-端那邊的基團 (R)。Chymotrypsin 的專一性辨認區形成一個相當大的口袋，而且口袋內沒有極性的胺基酸，因此偏好水解 Trp, Phe, Tyr 的位置。 * E5-26 Ser 蛋白脢家族以其專一性區來辨識基質種類，基質的特性決定辨識區的構形。 Trypsin 有一個細長的專一性口袋，帶底還有一個 Asp 189，因此其基質都是 Lys 與 Arg 等帶有正電荷的長條胺基酸。 構形的確決定了很多蛋白質的功能與作用。 * 第二章酶学基础概论 一、酶的组成 结合部位决定酶的专一性，催化部位决定酶所催化反应的性质。 必需基团 底 物 活性中心 结合基团 催化基团 活性中心：酶分子中结合底物并起催化作用的少数氨基酸残基形成的一定空间结构。 包括底物结合部位和催化部位。 Hexokinase structure Active sites are the clefts or crevices to which the substrate binds. 酶与底物接触的部位仅局限于十几个氨基酸残基。就体积而言，活性部位仅占酶分子的1％~2％,面积一般不到酶分子表面积的5％。 胰凝乳蛋白酶原通过水解去掉12-15 及 147-148的 氨基酸残基而激活，成为胰凝乳蛋白酶，两者的空间 结构几乎完全重叠，而酶活差异巨大。 一、酶的组成 结合部位决定酶的专一性，催化部位决定酶所催化反应的性质。 必需基团 底 物 活性中心 结合基团 催化基团 活性中心：酶分子中结合底物并起催化作用的少数氨基酸残基形成的一定空间结构。 包括底物结合部位和催化部位。 O O N–C–C–N–C–C N–C–C–N–C–C R H R’ Chymotrypsin 活性区 O - C Ser 活 性 区 专一性 结合区 催化区 丝氨酸蛋白酶的专一性不同 COO- C Asp 酶活性区 Trypsin Chymotrypsin Elastase 切 Lys, Arg 切 Trp, Phe, Tyr 切 Ala, Gly Non-polar pocket Deep and negatively charged pocket Shallow and non-polar pocket O O –C–N–C–C–N– C C C C NH3 + O O –C–N–C–C–N– C O O –C–N–C–C–N– CH3 Juang RH (2004) BCbasics 7种氨基酸残基出现在活性部位的频率最高： Ser、His、Cys、Tyr、Asp、G1u和Lys 其次是Arg、Asn、Gln、Trp 二、酶的分类 （一）根据酶蛋白组成上的特点，可把酶分为4类。 1.单体酶：只有一条肽链的酶。 2.寡聚酶：由两个或以上的亚基组成的酶。 3.多酶复合物：几个功能相关的酶以不同的形式嵌合而成的复合物 4.多酶融合体：由一条多肽链组成却具有多种不同催化功能的酶。 （二）按其催化的反应类型，分为六大类 1．氧化还原酶：催化底物进行氧化还原反应 . 反应通式：  可的松合成中的关键步骤 C11α -位羟基化 可的松是肾上腺皮质激素类药物，也是很多甾体药物的重要原料。其C11α-位羟基化是关键步骤，一般使用黑根霉(Rhizopus nigricans)中的11a-羟化酶催化 他仑帕奈的合成途径中羰基的还原 他仑帕奈用于治疗震颤麻痹、惊厥和焦虑症， (S)-1-(3,4-亚甲二氧苯基)-丙烷-2-醇(50)是合成48的重要原料，利用Zygo saccharomyces rouxii中的还原酶立体选择性还原49-的羰基，得到的50 收率96％，ee值大于99.9％。 2．转移酶：催化底物之间进行某些基团的  转移或交换。 反应通式为： 转移酶分八类： 一碳基，酮醛基，酰基，糖基，羟基，含氮基，含磷基，含硫基。 转氨酶 L-天冬氨酸+苯丙酮酸 L-苯丙氨酸+草酰乙酸 3．水解酶：催化底物的分解或其逆反应。 反应通式： 氨基酸的拆分 4．裂合酶(裂解酶)