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遗传信息传递的 中心法则;第一节 DNA指导下RNA的合成;1. DNA指导的RNA聚合酶;;大肠杆菌RNA聚合酶(456 kD);转录泡,17bp;RNA合成过程;真核生物的RNA聚合酶
三种RNA聚合酶Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,它们专一地转录不同的基因,其转录过程和产物各不相同。三种RNA聚合酶对鹅膏覃碱的敏感性反应不同。;2.启动子和转录因子;;;大肠杆菌启动子共有序列; 真核启动子
分为类型I、II、III,分别由RNA pol I、II、III进行转录。
类型I、III启动子种类有限,分别控制rRNA前体基因和小分子RNA的转录。;类型I启动子由两部分保守序列组成:
核心启动子位于转录起始点附近(-45—+20)。
上游控制元件(UCE)位于-180—-107。
两部分都富含GC。; 类型II启动子
类型II启动子涉及众多蛋白质基因的表达控制。包括4类控制元件:
基本启动子
起始子
上游元件
应答元件
由相应的转录因子识别。
基本启动子序列中心在-25至-30左右,7bp保守区。称TATA框(TATA box)或Goldberg-Hogness框。 A63 A60
T82A97T93 A85A82
A37 T37;通用(基本)转录因子
通用转录因子(TFII):指在启动子部位与RNA聚合酶II形成起始复合物(作用于基本启动子),启动转录的蛋白质因子,含量丰富,种类较少 。为所有类型II启动子起始转录所必需。 ; TATA框是RNA Pol II和通用因子形成起始复合物的主要装配点。转录的起始位点处有一保守序列称起始子(initiator, Inr), DNA在此解开并开始转录,其共有序列为:
;;CAAT框
中心在-75处,9bp,共有序列GGT(G)CAATCT
功能:与RNA聚合酶结合
GC框
在CAAT框上游,序列GGGCGG,与某些转录因子结合。
CAAT和GC框均为上游序列,对转录的起始频率有较大影响。
;类别III启动子(为RNA pol III所识别)
涉及小分子RNA,如:5S和tRNA,scRNA的转录。它位于转录起始点下游,也就是基因内部。;3. 终止子和终止因子;;第23页/共82页;4. RNA生物合成的抑制剂;第二节 RNA转录后的加工; 细胞内的tRNA、rRNA相对稳定,半衰期一般为几个小时。所有的tRNA、rRNA都不是原初转录产物,都要经过一系列的加工才能成为有活性的分子。
原初转录产物的5’是三磷酸(pppG??pppA),
而成熟的tRNA、rRNA ,5’是单磷酸。
成熟 tRNA、rRNA分子都比原初转录物小。
所有的tRNA分子,都有原初转录物所没有的稀有碱基(A、G、C、U以外的碱基)。; 真核的mRNA多为单顺反子,含有多内含子。寿命比原核mRNA的长。在原初转录物中,通过RNA拼接反应而被去除的RNA序列。
原核mRNA为多顺反子,半衰期只有几分钟,一经转录即直接进行翻译,一般不需加工。但少数多顺反子mRNA需经过核酸内切酶作用,切成较小的单位后再进行转录,如:核糖体大亚基蛋白L10和L7/L12与RNA Pol b,b’亚基基因组成的混合操纵子。;1.? 原核生物RNA的加工
rRNA前体的加工
在原核生物中,rRNA基因与某些tRNA基因组成混合操纵子,可提高效率、节省空间(增加有效信息)。其它的tRNA基因也成簇存在,并与编码蛋白质的基因组成操纵子,它们在形式多顺反子转录物后,断裂成为rRNA和tRNA的前体,然后进一步加工成熟。
; E.coli共有三种rRNA
5S rRNA、16S rRNA、23S rRNA
rRNA原初转录物含6300个核苷酸,约30S。
E.coli有7个rRNA的转录单位(操纵子),它们分散在基因组的各处。每个转录单位由16SrRNA、23SrRNA、5SrRNSA以及一个或几个tRNA基因所组成。每个操纵子中tRNA基因的种类、数量和位置都各不相同。;;原核tRNA前体的加工
E.coli染色体基因组有60个tRNA基因,即某种a.a.
的tRNA基因不止一个拷贝。tRNA基因大多成簇存在,
或与rRNA基因,或与蛋白质基因组成混合转录单位。
tRNA前体加工步骤:
核酸内切酶(RNaseP、RNaseF)在tRNA两端切断。
核酸外切酶(RNaseD)从3’端逐个切去附加序列。
在tRNA3’端加上-CCA-OH。
核苷的修饰(修饰酶):甲基化
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