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γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA):抑制性神经递质 牛磺酸(taurine):胆汁酸的组成成分 组胺(histamine):血管舒张剂 氨基酸的两性解离和酸碱滴定曲线 HA ←→ A- + H+ 酸 碱 质子 pH=pKa/ +Log[A-]/[HA] (1)pKa/ 就是HA50%解离([碱] = [酸])时溶液的pH值, Ka/就是此时溶液的[H+] (2)当HA50%解离时,溶液的pH值等于pKa/ (3)pH = pKa/ 时,[碱] = [酸](50%解离) pH pKa/ 时,[碱] [酸](>50%解离) pH pKa/ 时, [酸] [碱](<50%解离) ★pH pI时,氨基酸带负电荷, COOH 解离成-COO-,向正极移动。 ★ pH = pI时,氨基酸净电荷为零 ★ pH pI时,氨基酸带正电荷,-NH2解离成-NH3+,向负极移动。 ? 肽键 氨基酸间脱水后形成的共价键称肽键(酰氨键), 蛋白质分子中AA残基连接的基本方式。 短杆菌肽S(抗生素) L-Leu-D-Phe-L-Pro-L-Val ? ? L-Orn L-Orn ? ? L-Val-L-Pro-D-Phe-L-Leu 蛋白质表面有许多极性基团,同时也存在少量疏水基团。根据蛋白质表面疏水侧链的多少和疏水性的差异,可以分离纯化蛋白质。 在柱层析的填料基质上连接一些疏水基团,可以利用蛋白质疏水侧链与层析基质上的疏水基团的相互作用,进行蛋白质的分离纯化。 根据蛋白质分子的大小和形状差异 混合的蛋白质样品按其分子大小依次洗脱、彼此分离 大的先洗脱、小的后洗脱 配体:能与某种蛋白质专一结合的分子 亲和层析:根据蛋白质的配体专一性分离目标蛋白 激素与受体蛋白,抗原与抗体,生物素与亲和素,酶与酶的底物、辅酶、抑制剂、效应物及其结构类似物。 免疫亲和层析 亲和层析柱-抗体 : 分离蛋白质混合液中的抗原 电泳:带电质点在电场中的移动速度和方向主要取决于它们的电荷性质、电荷数目、颗粒大小及形状。 聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE) ●非变性….(Native) ●SDS-…… .(SDS) ●双向电泳 ●毛细管电泳 SDS:十二烷基硫酸钠,带负电荷的阴离子去垢剂。 蛋白质用SDS处理后,高级结构解体,带净负电荷,凝胶电泳时的迁移率和它们的相对分子量成正比。 可用于测目标蛋白的相对分子量。 还原法:先用2-巯基乙醇处理使二硫键还原成巯基,再用烷化剂修饰巯基,阻止二硫键再度形成。 氧化法:先用过甲酸使二硫键断裂,生成半胱氨磺酸。再用烷化剂修饰巯基 酸水解: HCl(6mol/L) ,回流煮沸20h,完全水解。 不引起消旋作用,得到L-AA,但是,色AA完全被沸酸所破坏,羟基AA(丝氨酸及苏氨酸)有一小部分被分解,天冬酰胺和谷胺酰胺的酰胺基被水解下来 碱水解:与NaOH (5mol/L)共煮10-20h,完全水解。色氨酸是稳定的,但是,产生消旋现象,所得产物是D型和L型氨基酸的混合物(称消旋物),丝氨酸及苏氨酸Arg,Cys会受到破坏。 ①胰蛋白酶 :- Lys — X- 、 -Arg— X-? (X ≠ Pro) ②胰凝乳蛋白酶: - Tyr—X- 、-Trp—X-、-Phe—X- (X ≠ Pro) ③溴化氰: - Met—X - 产率85% 每一种方法产生的碎片都是不同的,但是一定有部分的重叠序列。每个碎片分别测序,然后利用重叠重构完整的肽链氨基酸顺序。 ④ 其它的酶也可以部分水解蛋白质多肽链 1. Edman法 (1)耦联 PITC + H2N—A-B-C-D pH8—9,40℃ PTC——A-B-C-
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