《生物计算技术应用》多重序列比对分析.pptVIP

Biocomputing technology— Multiple sequence alignment 思考题 (2) 7. 如果给你一个多重比对，如何将这个比对投影到特定 的两条序列上？要求画出投影路径。 8. 简述星形多重序列比对的基本思想，其中，核心序列 Sc的选择方法。 9. 简述Carrillo-Lipman的优化计算方法的基本思想。 10.已知打分函数：p(a,a)=1, p(a,b)=-1 , p(a,-)= p(-,b)=-2, 求序列 s=ACTG , t=ATCT 经过特定断点的序列比对。 11.简述树形多重序列比对的基本思想， 其中，AA算法原理是什么？ 12.简述CLUSTAL算法原理 Biocomputing technology— Multiple sequence alignment 思考题 (3) 13. 多重序列比对的特征统计矩阵的概念 14. HMM模型的基本原理 15. HMM的三个经典问题是什么？ 这三个问题用什么算法解决？ 算法的原理是什么？ Biocomputing technology— Multiple sequence alignment 隐马尔可夫模型 HMM Biocomputing technology— Multiple s