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大提质粒步骤
试剂配制:
1. 1M NaOH (400ml ):分子量为40,秤取16g NaOH,溶于400ml DDW中。
2. 2M Tris-HCl (500ml):分子量为121.14,秤取121.14g Tris,溶于400 ml DDW中,用HCl调节pH值为8.0,定容至500ml。
3. Buffer P1 (1000ml):用50ml离心管量取20ml 0.5M的EDTA,然后量取25ml 2M 的Tris-HCl,加入700ml DDW,用HCl调节pH值为8.0,定容至1000ml。
4. Buffer P2(1000ml):称取10g SDS,放入1000ml的玻璃瓶中,然后加入750ml DDW,最后加入200 ml 1M的NaOH,混匀,室温放置过夜,使其自溶。(注:不需要定容,严格按步骤操作。)
5. Buffer P3 (1000ml):秤取294.42g乙酸钾,溶于800ml DDW中,用冰醋酸调节pH值为5.5,定容至1000ml。
6. Buffer QBT(1000ml):分别称取NaCl 43.83g,MoPS 10.46g,加入600ml DDW,用NaOH调节pH值为7.0,然后加入150ml 异丙醇,定容至1000ml。
7. Buffer QC(1000ml):分别称取NaCl 58.44g,MoPS 10.46g,加入600ml DDW,用NaOH调节pH值为7.0,然后加入150ml异丙醇,定容至1000ml。
8. Buffer QF(1000ml):称取NaCl 73.05g,量取2M Tris-HCl 25ml,加入800ml DDW,用NaOH调节pH值为8.5,然后加入150ml 异丙醇,定容至1000ml。
9. 10×TE Buffer:量取1MTris-HCl(pH8.0) 100ml,500mM EDTA(pH8.0) 20ml,加入800mlDDW,均匀混合后定容至1L。
10. 配制RNase:
(1) 将RNase粉末溶于10mM的乙酸钾(即Buffer P3),配制成浓度为10mg/ml的溶液。
(2) 将配好的RNase溶液100℃加热10min, 随后冷却至室温。
(3) 用1M 的Tris-HCl调节pH值至7.4,大约需要0.1体积的Tris-HCl。
(4) 分装RNase溶液于1.5ml EP管中,-20℃保存。
使用前注意事项:
在提low-copy(低拷贝)质粒时,增加lysis buffer(裂解液)体积可以提高碱性裂解的效率以及DNA的产量。
Buffer P1在使用前加RNase A solution(RNA酶溶液),一瓶Buffer P1加入一小瓶RNase A(用前瞬时离心),终浓度为100ug/ml。
检测Buffer P2是否有因低温储存而引起的SDS沉淀。如有必要,将SDS在37℃溶解。
Buffer P3在4℃下预冷。
在选择平板上挑选一个单克隆,在相应抗性的LB2—5ml中进行初培养:37℃摇床300rpm下初培养约8h。
(使用的管子或烧瓶至少是培养体积的4倍。)
2、将初培养菌液用选择性LB培养基稀释到1/500到1/1000。High-copy plasmid(高拷贝质粒):用100-200ul初培养液接种100ml介质。Low-copy plasmid(低拷贝质粒):用250-500ul初培养液接种500ml。37℃摇床300rpm下初培养约12-16h。OD600?=4-5,此时培养细胞浓度可达到约3-4×109个/ml。
(使用的烧瓶或容器至少是培养体积的4倍。)
3、4℃离心机6000g离心15min收集细菌细胞。
(如果想在此步骤停止以后再做,把细胞-20℃冻存。)
10mlBuffer P1重悬细菌细胞。
(确保Buffer P1里已经加入RNase A。为使细菌完全重悬,用振荡器充分溶解菌液沉淀。)
加入10mlBuffer P2,轻轻上下颠倒封盖的管子4-6次彻底混合溶液,室温(15-25℃)下放置5min。
(不要斡旋,因为斡旋能导致基因组DNA被剪断。裂解液会有粘性。溶解反应不要超过5min。装有Buffer P2的瓶子用后要立即盖紧,以免被空气中的CO2酸化。)
加10ml预冷的Buffer P3,立即轻轻上下颠倒4-6次混匀,冰上放置20min。
(预冷的Buffer P3和冰上放置能促进沉淀。加入Buffer P3后有乳白色的物质形成且裂解液粘性减少。沉淀物中含有基因组DNA、蛋白质、细胞残渣。)
20 min后,6000 g 4℃离心25min。同时,向柱子中加入10ml Buffer QBT,使其全部流过柱子,平衡柱子。
剪一小块纱布,折叠4层,放
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