生物化学王镜岩蛋白质的高级结构.pptxVIP

第六章 蛋白质的高级结构蛋白质的二级结构蛋白质的超二级结构和结构域蛋白质的三级结构蛋白质的四级结构研究蛋白质空间结构的方法X射线晶体衍射法使研究蛋白质空间结构的主要方法核磁共振光谱法研究蛋白质在溶液中的构象X衍射决定蛋白质空间结构X-Ray衍射决定蛋白质空间构象核磁共振研究蛋白质的立体结构核磁共振是确定蛋白质分子在溶液中的动态结构的唯一方法Kurt Wuthrich,瑞典科学家2002年获得诺贝尔奖氢原子的核磁共振谱维持蛋白质分子构象的作用力a.盐键b.氢键c.疏水键d.范得华力e.二硫键肽键 肽键的特点是氮原子上的孤对电子与羰基具有明显的共轭作用。组成肽键的原子处于同一平面。肽键中的C-N键具有部分双键性质，不能自由旋转。在大多数情况下，以反式结构存在。酰胺平面与α-碳原子的二面角（ φ和ψ ） 二面角 两相邻酰胺平面之间，能以共同的Cα为定点而旋转，绕Cα-N键旋转的角度称φ角，绕C-Cα键旋转的角度称ψ角。φ和ψ称作二面角，亦称构象角。酰胺平面非键合原子接触半径α-碳原子侧链酰胺平面完全伸展的多肽主链构象Φ=1800，ψ=1800Φ=00，ψ=00Φ=00，ψ=00的多肽主链构象蛋白质的二级结构　蛋白质的二级结构（secondary structure）指肽链主链不同区段通过自身的相互作用，形成氢键，沿某一主轴盘旋折叠而形成的局部空间结构，是蛋白质结构的构象单元．主要有以下类型：(１) α－螺旋（α－helix）(２) β－折叠（β-pleated sheet）(３) β－转角（β-turn）(４) 无规则卷曲（nonregular coil）Pauling的生涯Linus Carl Pauling (1901-1994)1926年，留学Sommerfeld实验室（1年7个月）1928年，发明杂化轨道， 创立量子化学1930年，去Laurence Bragg实验室学X-ray衍射1936年，与Mirsky一起发表蛋白质变性的理论---氢键1937年，开始搭α-helix的模型，发现5.4A的周期，与 Astbury的Keratin蛋白测定得到的5.1A不符。此后化了约10年的时间测定各种含肽键的小分子的结构，得出肽键的6个原子在同一平面上的结论1949年，人造丝X-ray数据发表，他看到了5.4A的周期1950年， α-helix模型发表，次年发表β-sheet模型1954年，Nobel化学奖1963年，Nobel和平奖70年代，提倡Vitamin C治百病80年代，盐湖城丑闻/biography/Pauling.html特征：1、 每隔3.6个AA残基螺旋上升一圈，螺距0.54nm; 2 、 螺旋体中所有氨基酸残基R侧链都伸向外侧，链中的全部C=0 和N-H几乎都平行于螺旋轴; 3、每个氨基酸残基的C=0与前面第三个氨基酸残基的N-H 形成氢键，肽链上所有的肽键都参与氢键的形成。形成因素：与ＡＡ组成和排列顺序直接相关。多态性：多数为右手（较稳定），亦有少数左手螺旋存在（不稳定）；存在尺寸不同的螺旋。 α－螺旋（α－helix）形成因素：与ＡＡ组成和排列顺序直接相关。β－折叠（β-pleated sheet）特征：两条或多条伸展的多肽链（或一条多肽链的若干肽段）侧向集聚，通过相邻肽链主链上的N-H与C=O之间有规则的氢键，形成锯齿状片层结构，即β－折叠片。类别：平行 反平行特征：多肽链中氨基酸残基n的羰基上的氧与残基（n+3）的氮原上的氢之间形成氢键，肽键回折1800 。 β－转角（β-turn）无规则卷曲示意图无规则卷曲细胞色素C的三级结构纤维状蛋白质纤维状蛋白质：动物体的基本支架和外保护成分，分子具规则的线性结构。弹性蛋白：存在于结缔组织不溶性（硬蛋白）α角蛋白：主要存在于毛发中角蛋白β角蛋白：天然存在于丝中，丝心蛋白纤维状蛋白质胶原蛋白：结缔组织中（骨、皮肤等）大量存在可溶性蛋白肌球蛋白血纤蛋白原其它说明： α角蛋白经充分伸展后可转变成β角蛋白，即β折叠片结构。4. 蛋白质的超二级结构(１)超二级结构（ supersecondary structure ）　蛋白质中相邻的二级结构单位（即单个α－螺旋或β－折叠或β－转角）组合在一起，形成有规则的、在空间上能辩认的二级结构组合体称为蛋白质的超二级结构　基本组合方式：αα；β×β；βββΒ-链βαββ×βαα1 2 3 4 5 5 2 3 4 1 回形拓扑结构β -迂回β -迂回βββ回形拓扑结构超二级结构类型黄素蛋白 丙糖磷酸异构酶 乳酸脱氢酶结构域1 丙酮酸激酶结构域4 羧肽酶 腺苷酸激酶 (a)