彻底搞清楚promoter, exon, intron, and UTR (有图有真相).pptVIP

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2020-02-26 发布于广东
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彻底搞清楚promoter, exon, intron, and UTR (有图有真相).ppt

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彻底搞清楚promoter, exon, intron, and UTR 启动子: RNA聚合酶特异性识别和结合的DNA序列。 promoter自然不属于intron和Exon的任何一个，属于noncoding sequence。 noncoding RNA是现在研究的热点之一。我们常见的MiRNA,SiRNA, antisense RNA tech,这些都是属于ncRNA的范围。只要你在进一步问下：这些RNA是哪里来的？你就知道部分答案，跟那些看似跟编码蛋白没有关系的DNA序列有关系。这部分DNA有个统称就junk DNA，垃圾ＤＮＡ或者冗余DNA，他们编码的RNA就属于 ncRNA.RNAi就是迄今最经典的ncRNA功能典范。 An exon is a sequence of DNA that is expressed (transcribed) into RNA and then often, but with many noteworthy exceptions[1] , translated into protein. Adjacent exons may be separated by an intron, which is later removed from the RNA transcript via the splicing mechanism. (From Wikipedia) UTR（Untranslated Regions)即非翻译区，是信使RNA（mRNA）分子两端的非编码片段。　　 5-UTR从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子，3-UTR从编码区末端的终止密码子延伸至多聚A尾巴（Poly-A）的末端。 * 转录（Transcription）是遗传信息从DNA到 RNA的转移。即以双链DNA中的一条链为模板，以ATP、CTP、GTP和UTP4种核苷三磷酸为原料，在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。 Promoter gene CDS DNA： Pre mRNA： CDS CDS Mature mRNA： CDS CDS CDS Poly A XXXXXXAUGXXXX………………..…....UGAXXXXXXXXXXAAUAAAAAAAAAA start codon: AUG stop codons ：UGA, UAG, UAA 5UTR 3UTR PolyA ATGXXXXXXXXX…..XXXXXXXTGA ORF(open reading frame ) cDNA： TSS: transcription start site CDS(Coding sequence) PolyA是后来加上去的。 Gene里没有 cDNA中有。 5UTR 3UTR 3UTR 5UTR cap Intron 1 Exon 1 Exon 2 Intron 2 Exon 3 Gray area: 5UTR (1-45) TSS: transcription start site Green area: intron Intron1 (73-1216) CDS (46-72) Start codon: ATG 5UTR 3UTR Exon1 Intron1 Example1 IL17A interleukin 17A[Homo sapiens] Location : 6p12 Sequence : Chromosome: 6; NC_000006.11 gene 1..4252 mRNA join(1..72,1217..1419,2669..4252) CDS join(46..72,1217..1419,2669..2906) Exon2 Intron2 Exon3 Example1 IL17A interleukin 17A[Homo sapiens] Location : 6p12 Sequence : Chromosome: 6; NC_000006.11 gene 1..4252 mRNA join(1..72,1217..1419,2669..4252) CDS join(46..72,1217..1419,2669..2906) Gray area: 3UTR (2907-4252) Green area: intron Intron2 (1420-2668) CDS (2669-4252) End codon: TAA Exam