蛋白质组学研究中生物信息学.pptVIP

第4讲：基于生物质谱数据的互联网数据库搜索 母昭德 硕士生学位课程：蛋白质组学 本讲所要介绍的内容提要 Ⅰ、生物信息学的一般情况 Ⅱ、有关数据库的基础知识 Ⅲ、由双向聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴别的蛋白质数据库 Ⅳ、目前利用生物质谱数据进行搜索时相关的主要数据库 Ⅴ、搜索引擎-ExPASy Ⅵ、以生物质谱数据从互联网数据库进行搜索 Ⅰ、生物信息学的一般情况 生物信息学（ Bioinformatics）是一门新兴的交叉学科，它包括了生物信息的获取、处理、存取、发布、分析、和解释等在内的所有方面。 生物信息学综合运用生物学、数学、计算机科学的各种工具，来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。 生物信息学在蛋白质组学中的应用概况 生物信息学已经成为蛋白组学研究中必不可少的组成部分，其应用包括： 编码的DNA序列的寻找与分析 蛋白质序列信息的获取 蛋白质鉴定和性质预测 蛋白质结构和功能预测 蛋白质序列分析 数据的分析与整合 Ⅱ、有关数据库的基础知识 生物信息学数据库：是长期存放在计算机内，有组织的、可共享的、表明了一些事实性的信息的数据集合。 数据库系统：是一个可实际运行的存储、维护和应用系统，是提供数据的软件系统，是存储介质、处理对象和管理系统的集合体。 数据库是生物信息学的基础。 Alberto Labarga, Franck