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质粒 质粒(Plasmid):是一类存在于细菌和真菌细胞中独立于DNA而自主复制的共价、闭合、环状DNA分子(covalently closed circular DNA),也称为cccDNA,其大小通常在1~100KB范围内。 质粒的分类 质粒分为两类: 1.严紧型:当细胞染 色体复制一次时,质粒也复制一次,每个细胞内只有1~2个质粒。 2.松弛型:当染色体复制停止后仍然能继续复制,每一个细胞内一般有20个左右质粒。 质粒 质粒的形式: ①超螺旋DNA:在细菌细胞内,共价闭环质粒以超螺旋形式存 在。 ②开环DNA:如果质粒DNA两条链中有一条链发生一处或多处 断裂,分子就能旋转而消除链的张力,形成松弛 型的环状分子,称开环DNA。 ③线状DNA:如果质粒DNA的两条链在同一处断裂,则 形成线状DNA(LinearDNA)。 当提取的质粒DNA电泳时,同一质粒DNA其超螺旋形式的泳动速度要比开环和线状分 子的泳动速度快。 当用强热或酸、碱处理时,细菌的线性染色体DNA变性,而共价闭合环状DNA的两条 链不会相互分开,当外界条件恢复正常时,线状染色体DNA片段难以复性,而是与变 性的蛋白质和细胞碎片缠绕在一起,而质粒DNA双链又恢复原状,重新形成天然的超 螺旋分子,并以溶解状态存在于液相中。 质粒的提取 从细菌中分离质粒DNA的方法都包括3个基本步骤: 1.培养细菌使质粒扩增; 2.收集和裂解细胞; 3.分离和纯化质粒DNA。 采用强碱液、加热或溶菌酶(主要针对革兰氏阳性细菌)可以破坏菌体细胞壁。 十二烷基磺酸钠(SDS)和TritonX-100(一般很少使用)可使细胞膜裂解。 经溶菌酶和SDS或Triton X-100处理后,细菌染色体DNA会缠绕附着在细胞碎片上,同时由于细菌染色体DNA比质粒大得多,易受机械力和核酸酶等的作用而被切断成不同大小的线性片段。 质粒 碱-SDS质粒小量制备 (1)培养物1.5ml,置于离心管内。 (2)10000g离心2min,弃上清。 (3)100ul预冷的solutionⅠ重悬,振荡2min。 (4)常温放置5min。(充分裂解释放DNA) (5)200ul solutionⅡ,上下颠倒5s。(不要太剧烈,振荡会损伤DNA) (6)水浴5min,12000g离心5min。 (7)加200ul冰上预冷的solutionⅢ,上下颠倒20s,混匀。 (8)水浴5min,12000g离心5min,将上清移至新的EP管内。 (9)加入5ul 2mg/mlRNaseA,37度放5min。 (10)加入(≤450ml)的酚-氯仿抽提。(见后) (11)乙醇浓缩。(见后) (12)70%乙醇沉淀,离心1min,吸去上清,挥发干酒精。 (13)25ulTE重悬沉淀,2-4ul电泳。 (14)-20℃保存。 Thanks
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