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实验1 聚合酶链式反应(PCR)技术
【实验目的】
掌握PCR反应的原理及操作技术。
【实验原理】
PCR 技术实际上是在模板DNA、引物和4 种脱氧核苷酸存在的条件下依赖于耐高温DNA 聚合酶的体外酶促合成反应。PCR 技术的特异性取决于引物和模板DNA 结合的特异性。反应分为三步:1 热变性:在高温条件下,DNA 双链解离形成单链DNA;2 退火:当温度突然降低时引物与其互补的模板在局部形成杂交链;3 延伸:在DNA 聚合酶、dNTPs 和Mg2+存在的条件下,聚合酶催化以引物为起始点的DNA 链延伸反应。以上三步为一个循环,每一循环的产物可以作为下一个循环的模板,几十个循环之后,介于两个引物之间的特异性DNA 片段得到了大量复制,数量可达到10 6~7 个拷贝。
【器材与试剂】
1.器材
DNA 扩增仪(PCR 仪)、台式离心机、微量取液器、硅烷化的PCR 小管、琼脂糖凝胶电泳系统
2.材料
模板DNA,单、双链DNA均可作为PCR的样品。
3.试剂
(1) 10×PCR 缓冲液
(2) MgCl2 15mmol/L
(3) dNTP 混合物:每种2.5mmol/L
(4) Taq DNA 聚合酶:5U/μl
(5) 引物1和引物2:2 μmol/L
(6) 琼脂糖凝胶电泳试剂
【操作步骤】
1. 在0.2ml Eppendorf 管内依次混匀下列试剂,配制20μl 反应体系。
ddH2O
7.8 μl
10×PCR 缓冲液
2 μl
MgCl2(15mmol/L)
2 μl
dNTP(2.5mmol/L)
2 μl
引物1 (2μmol/L)
2 μl
引物2 (2μmol/L)
2 μl
模板DNA
2 μl
Taq DNA 聚合酶(5U/μL)
0.2 μl
总体积
20 μl
2.按下述循环程序进行扩增
程序阶段
程序名称
温度
时间
循环数
1
预变性
94℃
3 min
1
变 性
94℃
30 sec
30
2
退 火
52℃
30 sec
延 伸
72℃
30 sec
3
保 温
4℃
∞
1
3.扩增结束后,取10μl 扩增产物进行电泳检测。
【要点提示】
1.在90~95℃下可使整个基因组的DNA变性为单链。一般94~95℃下30~60sec。时间过长使TaqDNA聚合酶失活。
2.退火温度一般在45~55℃。退火温度低,PCR特异性差;退火温度高,PCR特异性高,但扩增产量低。。
3.延伸温度一般在70~75℃。此温度下TaqDNA聚合酶活性最高。一般扩增产物长度小于1 kb,延伸时间30 sec即可。当扩增产物长度大于1 kb时,可适当延长延伸时间。
4.引物长度通常用20bp左右。 两个引物扩增的片段大小300~500bp为宜。
【思考题】
PCR反应的原理是什么?
如何确定PCR反应中的退火温度和延伸时间?
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