GROMACS使用教程要点.doc

GROMACS教程 一 Gromacs基本模拟流程 .......................................................................................... 3 1 下载pdb文件..................................................................................................... 3 2 用pdb2gmx 处理 pdb 文件 ............................................................................ 3 3 建立盒子............................................................................................................. 3 5 设置能量最小化................................................................................................. 4 6 用grompp程序进行文件处理 ..............