布氏菌 多位点序列分型 聚类分析论文.docVIP

布氏菌论文：中国布氏菌的多位点序列分型研究 【中文摘要】:在原有的7个管家基因和1个外膜蛋白的基础上,新增加Ⅳ型分泌系统中的两个毒力因子,利用多个管家基因的序列进行分型,建立一种适用于布氏菌的分辨率较高的ST分型方法,用于中国布氏菌分离株的分型,了解菌株的遗传特征及遗传进化关系,为我国布氏菌分子流行病学的研究提供依据。方法:以PCR技术为基础,应用测序技术进行多位点序列分型(Multiple locus sequence typing,MLST)研究。选取1953年到2010年我国不同地区分离到的164株布氏菌分离株和3株疫苗株作为研究对象。通过对国际标准株的比较评价实验的真实性,用血清学、噬菌体等方法对164株分离株进行再次鉴定验证实验的可靠性。在此基础上对164株布氏菌分离株和3株疫苗株的10对基因的扩增产物进行测序,对比得到各基因的等位基因,从而判定其ST型,利用MLST在线工具(NRDB、LIAN、eBURST、Tree drawing),对序列的等位基因型、序列型分离、连锁平衡、聚类、进化树等进行分析,确定序列型、了解菌株间的进化关系。结果:(1)以布氏菌属的17株国际标准菌株作为参照,结果显示:菌株的完全符合率为81... 【英文摘要】: To