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其它进展 合成生物学: Review Warren C. Ruder, Ting Lu, James J. Collins. Synthetic Biology Moving into the Clinic. Science 2011 , 333 : 1248-1252 最早合成基因网络: T. S. Gardner, C. R. Cantor, J. J. Collins, Nature 403, 339 (2000) ; M. B. Elowitz, S. Leibler, Nature 403, 335 (2000) 临床应用示意图 合成生物学 细菌感染的治疗 抗生素杀菌都是诱导 DNA 损伤,会使细菌 SOS 系统激活 非裂解性 M13 (非裂解性可减少细菌适应系统的激活)通过遗传操作高表 达 lexA3 (细菌 SOS 系统的抑制子)以及抗生素 癌症治疗 传统方法:手术,放射治疗,化疗 合成生物学: 1 )构建只感染癌细胞的工程菌: 工程菌仅在缺氧环境下感染(缺氧环境通常是肿瘤组织的指示) 大肠杆菌表达入侵粘附蛋白(与哺乳动物整合素受体结合),启动子为厌氧诱导 的甲酸脱氢酶启动子,因此工程菌仅在厌氧条件下感染肿瘤细胞。 2 )工程菌抑制肿瘤相关基因的表达 工程菌通过 RNAil 抑制 CTNNB1 (编码 beta-1 catenin ,连环蛋白) 表达, CTNNB1 起始许多结肠癌的 发生 疫苗制备 合成脂质体,包裹有重组的细菌转录 - 翻译网络、编码抗原的 DNA ,可在体 内产生抗体 微生物组( microbiome )工程 在人体中寄生着数量巨大( 10 13 ~ 10 14 )的微生物。多种微生物参与人体发 育、生理调节、免疫、营养吸收等各种生命活动中,与人类建立了稳定和谐 的共生关系。这些微生物基因组统称为 Microbiome ,其基因总量大概是人类 基因组中基因总量的一百倍,这些外源基因的参与可能是解释某些复杂生命 科学问题的关键。 Microbiome 的研究中有两个基本的科学问题:是否存在一 个核心的 Microbiome 构成为大部分人类所共有;人体内 Microbiome 的变化是 否与人类健康存在必然联系。 大肠杆菌产生 AI-2 ( autoinducer 2 ) 以分泌 CAI-1 ( cholera autoinducer 1 ),从而产生毒素,杀死霍乱菌 合成生物学: Review Nagarajan Nandagopal and Michael B. Elowitz. Science 2011 , 333 : 1244-1248 合成生物学:最早,单个基因 现在,某个代谢、信号通路等中的多个基因 人工合成基因组:细菌 Science 2008, 319: 1215 合成酵母部分基因组:首次合成真核生物部分染色体 具有野生型相似的表型和适应性,无 tRNA 基因和转座子 Jessica S. Dymond et al. 2011. Nature 477: 471-476 单分子技术 单分子技术:在单分子水平对生物大分子的行为(包括构象变化、相互 作用、相互识别等)进行实时﹑动态检测,以及在此基础 上的操纵﹑调控等,是纳米技术和分子生物物理学的自然 延伸和必然趋势。 生命单元的基本功能主要取决于单个大分子,与测量分子集合体整体性 质的传统方法 ( 如光散射,光偏振,粘滞性等 ) 相比,单分子技术具 有直接,准确,实时等优点 主要的研究手段有两种: 1 )单分子光谱学( Single-molecule spectroscopy 和 Single-molecule FRET ) 2 )单分子力谱( AFM 和光镊) 单分子技术实验指南,科学出版社, 2010
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