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肿瘤基因组学与肿瘤精准医疗
摘要:随着人类基因组计划的完成、肿瘤基因组计划的实施和一系列靶向药物的出现,肿瘤的诊断与治疗已开始迈入精准医学的时代。精准医疗(precision medicine)又称为个性化医疗,是根据个体基因特征、环境以及生活习惯,为病人量身设计出最佳治疗方案,以期达到治疗效果最大化和不良反应最小化的一种定制医疗模式。作为一种全新的医学概念与医疗模式,日益在恶性肿瘤临床治疗中显示出价值。人类基因组计划的完成和测序技术的飞速发展,极大地促进了肿瘤基因组测序研究,发现了大量与肿瘤相关的基因组改变,肿瘤基因组学随之兴起,肿瘤基因组学就是通过大规模的测序来建立肿瘤基因组图谱,从而阐明各类肿瘤的基因组变异规律及其在肿瘤发生发展过程中的作用。肿瘤基因组学为肿瘤的个体化精准治疗提供理论和技术支撑。
关键词:基因组计划 基因组学 肿瘤 精准医疗
肿瘤是严重威胁人类健康的疾病之一。据最新统计,全球每年肿瘤新发病例1400万,死亡820万,全球患肿瘤病例超过2500万。2015年中国癌症新发430万例,癌症死亡280万例。近半个世纪以来,恶性肿瘤一直是生物医学研究的主题。随着人类基因组计划的完成、肿瘤基因组计划的实施,肿瘤的诊断与治疗已开始迈入精准医学的时代,大规模基因测序技术的广泛应用,人们对恶性肿瘤的发生、发展有了更多的认识,在部分肿瘤的诊断与治疗方面取得显著进展。
1.从人类基因组计划到精准医疗计划
1984年12月,美国能源部组织一批生物学家在阿尔塔召开会议。他们试图回答一个问题:40年前发生原子弹爆炸的长崎和广岛,其幸存者基因的突变率是否增加?这次会议就是人类基因组计划的起源。1986年,诺贝尔医学奖获得者DULBECCO发表文章指出,如果要更多的了解肿瘤,就必须把研究集中到细胞的基因组上。1990年4月,美国国立卫生研究院和能源部宣布,计划耗资30亿美元、在15年内完成人类基因组30亿个碱基的序列分析,DNA双螺旋结构发现者詹姆斯·沃森为该项目的总负责人。这就是著名的“人类基因组计划”(HGP),该计划与曼哈顿原子弹计划和阿波罗登月计划并称为20世纪的三大科学计划。2000年6月26日,美国总统克林顿宣布,由美国、英国、日本、法国、德国和中国共同承担的人类基因组工作草图胜利完成。2003年4月,在DNA双螺旋结构发现50周年之际,弗朗西斯·柯林斯发表文章,宣布人类基因组的精细图谱顺利完成。如前所述,启动人类基因组计划的主要动机就是攻克癌症。所以,2005年12月,美国宣布肿瘤基因组计划(TCGA),计划用10年时间、耗资13.5亿美元,对1.25万份肿瘤样本进行基因测序。2008年10月,TCGA团队报告了胶质瘤肿瘤患者的全基因组序列分析图谱;到目前为止,TCGA团队共完成33种不同类型的肿瘤、11000例患者的基因组测序工作。其相关的研究成果先后在《Nature》 《Cell》和《New England Journal of Medicine》杂志发表学术论文数十篇。2015年1月20日,美国总统贝拉克·奥巴马在国情咨文演讲中正式推行了“精准医学计划”,希望精准医学可以引领一个医学新时代,使人类更接近于治愈癌症和糖尿病等疾病的目标 ADDIN EN.CITE ADDIN EN.CITE.DATA ( \o Porche, 2015 #118 1)。白宫官网发布精准医疗计划的相关细节,随后美国癌症研究协会年会在美国召开,此次会议汇集了目前所有癌症主要领域的最先进研究成果 ,“精准医疗”的概念再次聚焦了全球的目光。
2.肿瘤基因组学
大量的研究资料表明,肿瘤的发生、发展是一个多基因变异累积的过程。从全基因组层面比较正常组织和肿瘤组织基因的突变、扩增、缺失、易位和甲基化水平,对于阐明肿瘤发生的分子机制具有重要意义。肿瘤基因组学就是通过大规模的测序来建立肿瘤基因组图谱,从而阐明各类肿瘤的基因组变异规律及其在肿瘤发生发展过程中的作用。肿瘤基因组计划实施的10年,获得哪些新的知识?2013年VOGELSTEIN等 ADDIN EN.CITE EndNoteCiteAuthorVogelstein/AuthorYear2013/YearRecNum124/RecNumDisplayText(2)/DisplayTextrecordrec-number124/rec-numberforeign-keyskey app=EN db-id=rpx0espvarwptsedx9n5p2ple2v2vtsrffws124/key/foreign-keysref-type name=Journal Article17/ref-typecontributorsauthorsauthorVogelstein, B./authorauth
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