KEGG上的信号通路图怎么看.pdf

. KEGG 上的信号通路图怎么看？ 提示：请点击标题下方蓝色 “实验万事屋 ”，添加关注后，发 “嗯 ”可以查看我们之前 的文章。 未经允许，其他公众号不得转载哦！ 想要把自己研究的分子扯上明星分子或者明星通路？那是不难，难的是具体到底要 怎么去扯，芯片结果啊，生信结果啊，都会给你提示，但真的要具体扯上去，还得 看懂那些七七八八的信号通路图。 KEGG Pathway 上有着大量的信号通路图，画得一个复杂啊！巨坑爹有没有？曾经 有师弟说我之前曾经把 Wnt 通路描述错了， 他师兄告诉他， 应该是 GSK- 3 β磷酸化 抑制 β-Catenin 降解，并促进它入核的。在这里，我们只能默默地祝福这位师兄了 …… 那我们就用 Wnt 通路来做例子吧。 先上 KEGG 下载一个 Wnt 的信号通路图， 如下： 绝壁是很高大上的不是么？这要咋看呢？ 其实这张图上把三个 Wnt 通路都画上去 了，也就是 Wnt/ β-Catenin （经典Wnt 通路）， Wnt/PCP （平面的细胞极性途径） 和 Wnt/Ca2+ （Wnt/ 钙离子）三条信号通路组成， 我们就删减一下，就光看经典的 Wnt 通路，就变成了下面这个模样： . . 感觉还是很高大上有木有？那就再删减一下， 把它变成经典 Wnt 信号通路的骨架会 是什么样呢？就是这样： 简洁明快了吧， 但要怎么来看懂这样的图呢？我们来看一下 KEGG Pathway 的具体 图例： . . 把这些图例用来解释经典 Wnt 信号通路骨架图，就变成了： 看懂了么？那给你从左到右解释一下： 1）Wnt 激活膜上受体，将信号传递到第二信使 Dvl ，活化的 Dvl 抑制由 Axin 、APC 和 GSK- 3 β组成的复合物的活性 ,使 β-catenin 不能被 GSK- 3 β磷酸化。 2 ）磷酸化的 β-catenin 才可通过泛素化 (ubiquitination) 而被胞浆内的蛋白酶体所降 解，由于非磷酸化的 β-catenin 不能被蛋白酶体降解，从而导致 β-catenin 在胞浆内 积聚，并移向核内。 . . 3 ）当游离的 β-catenin 进入细胞核内，即可与转录因子 TCF/LEF 结合，激活 TCF 转录活性，调节靶基因的表达。 那我们回过来看复杂一点的图上都讲了啥？ (看不清可以点击图片即可放大） 这个就是整个经典 Wnt 信号通路的调控机制了。我说看帖的你，明白 KEGG 的信 号通路该怎么看了