生物化学与分子生物学-第一章蛋白质结构与功能.pptVIP

Wang-Kai Fang, PhD（方王楷） wkfang@stu.edu.cn Department of biochemistry and Molecular Biology Shantou University Medical College ; 绪 论;研究内容 ;生物化学的发展简史;分子生物学的重要事件;生物化学---一门新兴的边缘学科;第一篇生物大分子的结构与功能;第 一 章蛋白质的结构和功能;一、什么是蛋白质?;二、蛋白质的生物学重要性;Proteins make up all living materials;1）作为生物催化剂（酶） 2）代谢调节作用 3）免疫保护作用 4）物质的转运和存储 5）运动与支持作用 6）参与细胞间信息传递;碳(C) 50%-55%; 一、氨基酸(amino acid) 蛋白质的构件分子（building blocks）;氨基酸的种类;丙氨酸的两种立体异构体;（一）氨基酸的分类;;;2） 8个极性中性氨基酸;;;4） 3个碱性氨基酸;组氨酸（His）;3） 2个酸性氨基酸;甘氨酸（Gly） 无光学活性; 脯氨酸 Pro （亚氨基酸）;? 半胱氨酸 Cys ;苯丙氨酸Phe、酪氨酸Tyr 和色氨酸Trp;苯丙氨酸的?max＝257nm 酪氨酸的?max＝275nm 色氨酸的?max＝280nm; 名 称 ;氨基酸残基侧链修饰 ;蛋白质共价修饰;;Protein Phosphorylation;磷酸化使蛋白质带上强烈负电基团;Protein Glycosylation Common in Eukaryotic Proteins;;（二） 氨基酸的理化性质;除碱性氨基酸外，其余氨基酸等电点均小于7;2.紫外吸收性质;（一） 肽与肽键;C;肽peptide;氨基酸在形成肽链时失去了一分子水，肽链中的氨基酸分子不再完整，称为氨基酸残基(amino acid residue);（二）生物活性肽;GSH过氧化物酶;种类较多，生理功能各异。 多肽类激素主要见于垂体及下丘脑分泌的激素，如催产素（9肽）、加压素（9肽）、促肾上腺皮质激素（39肽）、促甲状腺素释放激素（3肽）。 神经肽主要与神经信号转导作用相关，包括脑啡肽（5肽）、?-内啡肽（31肽）、强啡肽（17肽）等。;由下丘脑分泌，其功能是促进腺垂体释放促甲状腺素(调节糖代谢);神经肽 ;三、蛋白质的分类;2. 根据其形状分为：;3. 根据其结构特点进行分类：;第二节 蛋白质的分子结构;一、蛋白质的一级结构; 蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序称为蛋白质的一级结构;胰岛素的一级结构;二、蛋白质二级结构;肽键中，与Ｃ-Ｎ相连的O和H呈反式构型;C-N单键为0.149nm;肽键为共价键，具有部分双键性质，不能自由旋转。 参与肽键组成的6个原子C?1、C、O、N、H、C?2位于同一平面，此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元（酰氨平面） 。; 多肽链的主链由许多酰胺平面组成，平面之间以?碳原子相隔。; 蛋白质二级结构的主要形式;（一） ?-螺旋 (?- helix);;(2) 每3.6个氨基酸残基 绕成一个螺圈(3600);(3)主链原子构成螺旋的主体,侧链在其外部;(4)每个肽键的N-H和第四个肽键C-O都形成氢键;（二）?-折叠 (?-pleated sheet);;2. ?-折叠结构特点;(３)由氢键维持稳定。其方向与折叠的长轴 接近垂直;（三）?-转角(?-turn);（四）无规卷曲(random coil);结构域(structural domain);;三、蛋白质的三级结构;维系蛋白质结构的作用力;氢键;疏水相互作用;离子键;侧链基团之间形的 氢 键、离子键、 疏水作用、 分子引力、二硫键 ;疏水核：疏水区从位于分子内部，往往是与辅酶/基或底物结合位点;蛋白质三级结构的意义：;1963年Kendrew等通过鲸肌红蛋白的x-射线衍射分析， 测得了它的空间结构。　 ; ;四、蛋白质的四级结构;血红蛋白的四级结构 ;Mathews et al (2000) Biochemistry (3e) p.195; 第三节 蛋白质结构与功能的关系;牛核糖核酸酶的一级结构; 天然状态，有催化活性;;ACTH 促肾上腺素皮质激素;氨基酸序列提供重要的生物进化信息;镰刀状红细胞贫血;;; 二、蛋白质空间结构与功能的关系;Hemoglobin;肌红蛋白;血红蛋白; 血红蛋白在氧分压较低时，与氧气结合较难，氧解离曲线呈Ｓ状曲线。 但当氧与血红蛋白分子中一个亚基的血红素辅基的铁结合后，即引起该亚基构象的改变，一个亚基构象的改变又会引起其余亚基的构象相继发生改变，亚基间