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第一章RNA的提取和cDNA的合成
RT-PCR原理及应用
提取总RNA
反转录
CDNA
作模板
PCR
获得目的基因
应用:基因检测、基因转录产物的分析、
合成DNA探针、构建RNA高效转录系统
、RNA的提取
口RNA易降解,在提取过程中要严格防止RNA酶的
污染,并设法抑制其活性
口RNA酶稳定,并广泛存在,如各种组织、人的皮
肤、手指、试剂、容器等。
采取的措施:
1、全部实验过程中均需戴手套操作并经常更换(使
用一次性手套)。
2、所用的玻璃器皿需置于干燥烘箱中200℃C烘烤2小
时以上。
3、不能用高温烘烤的材料如塑料容器、试剂等可用
0.1%的焦碳酸二乙酯(DEPC水溶液处理,然后高
压灭菌以消除残存的DEPC。
注意事项:
1、DEPC与氨水溶液混合会产生致癌物。
2、DEPC能与胺和巯基反应,因而含Trs和DTT
二硫苏糖醇)的试剂不能用DEPC处理。
3、Tris溶液可用DEPC处理的水配制然后高压灭菌。
4、配制的溶液如不能高压灭菌,可用DEPC处理水
配制,并尽可能用未曾开封的试剂。
总RNA提取方法(试剂盒):
异硫氰酸胍-苯酚法( Trizol法)
原理:首先用强变性剂异硫氰酸胍裂解细胞,同时
使核蛋白复合体中的蛋白变性,释放出核酸。释
放出来的DNA和RNA由于在特定pH时溶解度不
同,分别位于整个体系中的中间相和水相,从而
使DNA和RNA分离开来。进一步通过有机溶剂
来抽提沉淀RNA,就可以得到纯净的RNA。
二、cDNA的合成
5× Buffer
4ul
dNtPs
6
RNA酶抑制剂
luI
Oligo(dT)
lul
随机引物
1ul
反转录酶AMV
1ul
提取的RNA
6ul
总体积
20ul
RhA
5·引物
↓玩转录两
T山
KNA-DNA杂交体
↓RNAH
↓DNA聚合酶
双佐DNA
口反转录酶:依赖于RNA的DNA聚合酶
种类:两种
1、禽类成髓细胞病毒(AMV)反转录酶
包括两个多肽亚基(最适温度42c)
活性:依赖于RNA的DNA合成,依赖于DNA的
DNA合成以及对DNA:RNA杂交体的RNA部分进
行内切降解(RNA酶H活性)。
2、鼠白血病病毒(MLV反转录酶
只有单个多肽亚基(最适温度37C)
活性:依赖于RNA和依赖于DNA的DNA合成活性,
但降解 RNA DNA杂交体中的RNA的能力较弱,
且对热的稳定性较AMv反转录酶差。
MLV反转录酶能合成较长的cDNA(如大于2-3kb)。
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