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- 2020-08-30 发布于天津
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Cl ustal x多重序列比对图解教程(ByRai n dy)
本帖首发于
软件简介:
CLUSTALX是CLUSTA多重序列比对程序的 Windows版本。ClustalX为进行多重序列和轮廓 比对和分析结果提供一个整体的环境。
序列将显示屏幕的窗口中。采用多色彩的模式可以在比对中加亮保守区的特征。 窗口上面的下
拉菜单可让你选择传统多重比对和轮廓比对需要的所有选项。
主要功能:
你可以剪切、粘贴序列以更改比对的顺序;
你可以选择序列子集进行比对;
你可以选择比对的子排列(Sub-range)进行重新比对并可插入到原始比对中; 可执行比对质量分析,低分值片段或异常残基将以高亮显示。
当前版本:
PS:如果你是新手或喜欢中文界面,推荐使用本人汉化的版
链接地址:(请完整复制)
应用:Clustalx 比对结果是构建系统发育树的前提
实例:植物呼肠孤病毒属外层衣壳蛋白 P8(AA序列)为例
流程:载入序列一 >编辑序列一 >设置参数一 >完全比对一 >比对结果
载入序列:运行ClustalX,主界面窗口如下所图(图1),依次在程序上方的菜单栏选择 “File ” — “LoadSequenc6载入待比对的序列,如图2所示,如果当前已载入序列,此时会提示 是否替换现有序列(Replaceexistingsequences),根据具体情形选择操作。
■ ClustalX (1.63)
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