16S、18S等扩增子测序.docVIP

16S、18S、ITS等扩增子测序 技术说明： 扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序。 16S rDNA测序 :?16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，主要进行细菌或古菌的多样性分析。 18S rDNA测序 :?18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，反映样品中真核生物之间的种类差异。 ITS 测序 :?该类测序主要对环境微生物中的真菌多样性进行分析。包含两个区域：ITS1位于真核生物核糖体rDNA序列18S和5.8S之间；ITS2位于真核生物核糖体rDNA序列5.8S和28S之间。? 技术路线： 扩增子原始序 扩增子原始序列 优化序列 PCA pCoA NMDS 样品聚类 物种分类数 各层级物种分类聚图 RDA/CCA分析 Metastasts分析 保释性曲线 各样品多样性指数 物种丰度曲线 Alpha多样性分析 Bata多样性分析 物种注释和统计分析 样本要求： 基因组DNA: m≥200ng, c≥6ng/μL PCR产物: m≥1 μg, c≥10 ng/μL ????????? ????????? 服务周期： 标准流程的服务周期约为 30-55 个工作日。 案例解析: 案例一 Defining the core Arabidopsis thaliana root microbiome. [ Na