01-从0搭建r语言数据分析平台.pdf

从 0 开始搭建 R 语言数据分析平台 本文从实用的角度，一步步搭建一个基于 R 语言的数据分析和可 视化（作图）平台，完成相关的系统配置和软件设置，达到“拿来即 用”的目的。本文是 “R 语言基础系列”的第一篇，该系列共分 3 篇， 第二篇讲 R 语言的基本操作，第三篇讲 R 语言的基本图形。这一系列 的介绍完成之后，读者已经可以利于 R 语言进行基本的数据管理、分 析和可视化工作。 本文包括 3 个部分：1、下载和安装 R、RStudio；2、相关配置和 设置；3、一些常见问题。 完成后的样子如下图所示： 1、下载和安装 R、RStudio 这两个软件都是开源软件，均可在网上自由下载，不需要付费注 册。R 支持 win7 以后的系统，win XP 已经不再支持。下载 R 的时候 要选择国内的镜像站点，这样速度更快。第一次安装选择 “base”选 项。进入下载页面，选择最新版本（当前为 4.02 ）：Download R 4.0.2 for Windows 。这个文件包含32bit 和 64bit 两个版本的组件，所 以不管系统是32bit 还是 64bit 都只下载这一个文件。等待文件 R 4.02 下载完成。该文件是一个可执行文件(.exe)，在windows 系统中双击 即可运行。 下载 RStudio 时，选择 RStudio Desktop Free （桌面版免费版）。 若是 64 位系统，则直接下载最新版本，当前版本是 1.3.1073.若是 32 位系统则点击页面下方的链接，下载老版本，版本号为 1.2.5042. 下载完成后得到两个可执行文件： 安装 R 和 RStudio： 首先，运行 R-4.0.2-win.exe. 选择安装语言，下一步，设置安装 目录，选择安装组件。 在 “选择组件”这一步要注意区分 32-位和 64-位 windows 系统。 若是 64-位系统则全选，若是 32-位系统则取消 64-bit Files 。 下一步，接受默认设置即可。 下一步，不要关联.Rdata 文件，稍后用 RStudio 关联。 等待安装完成。 接下来安装 RStudio： 双击运行安装程序，下一步选择安装目录，下一步安装，等待安 装完成即可。 2、相关配置和设置 （1）设置环境变量：涉及系统对 R 的调用。 右击计算机-属性-高级系统设置： 再点击右下角的“环境变量”： 然后编辑系统变量 PATH 的值，在原有值后面添加 R 启动文件的 位置，与原有值之间用英文分号 “; ”隔开，如： “;D:\Program Files\R\R-4.0.2\bin\x64”. （2 ）RStudio 界面的设置: Tools – Global Options – Appearance 中 设置编辑器主题（Editor theme），找一个黑色背景，这样在长时间编 写、阅读代码时眼睛受光线刺激较小。 （3 ）R 软件库的设置: Tools – Global Options – Packages 中设置 一个中国的镜像，这样安装软件时速度较快。 （4 ）设置面板：在 RStudio 工具栏中有一个田字格状的按钮， 可以设置面板的样式，将 R 控制台放在右侧（Console on Right ），这 样可以并排查看脚本编辑器代码和已运行的 R 控制台代码。 （5 ）安装 R 中常用的包：agricolae （农业田间试验）、nlme （非 线性混合模型）、xlsx （excel 文件读写）、reshape 2 （数据转换）、 ggplot2 （高级作图）、gplots （热图作图）、lme4 （线性混合模型）、 emmeans （边际效应）、psych （相关分析）、multcompView （多重比 较）。 图形化操作：在右下角的面板中，点击 Packages-Install，打开软 件包安装管理器： 输入软件包的名称，点击安