临床基因组学检验：第六章 多重连接探针扩增技术及片段分析技术.pptVIP

一、MLPA技术概述 二、MLPA技术原理/实验操作/结果分析 三、MLPA技术临床应用 四、MLPA技术特点 第六章 第一节 目录 《临床基因组学检验》 五、MLPA技术新发展 MLPA compared to other techniques MLPA优点 MLPA技术融合了DNA探针杂交和PCR技术的特点，且发扬了其连接依赖的特色，其优点： MLPA不足 1）不能探测染色体结构异常； 2）不能反映染色体的平衡易位和倒位现象； 3）目前尚不能用于单个细胞标本的检测； 4）进行染色体三体检查时，被污染的羊水样本不能用于检测； 5）尚不能用于检测短串联重复序列多态性（STR）； 6）尚不能检测未知的点突变； 7）探针设计来源于M13-Holland，耗时且困难。 一、MLPA技术概述 二、MLPA技术原理/实验操作/结果分析 三、MLPA技术临床应用 四、MLPA技术特点 第六章 第一节 目录 《临床基因组学检验》 五、MLPA技术新发展 五、MLPA技术新发展 （一）化学合成法制备探针 有如下特点： ①5端探针与3端探针长度基本相同； ②通过改变杂交序列的长度来区分各探针，或在5-、3-端探针中均设计长度不一的填充序列； ③相邻探针的长度相差3或4 nt； ④在一个反应体系中至多可检测20个不同的核苷酸序列，探针长度小于200 nt。 （二）MLPA-微阵列技术(Array-MLPA) 荷兰Pamgene公司开发建立。 这种芯片使用的是一种多孔渗透微阵列技术，通过将大量检测探针固定于氧化铝基片微孔内壁上以定量检测样本扩增产物，通过调节基片上下的空气压力使样本在基片微孔中来回渗透反应。 相对于平面介质而言，它的反应接触面积增加了500倍，极大地提高了反应效率。充分反应之后，用洗液来回渗透洗脱没有杂交的多余探针，降低背景噪声的干扰。最后，荧光被激发成像并转换成信号强度信息进行软件分析。 建立在微阵列基础上的MLPA 检测通量大、简便快速、自动化程度高 重点回顾 1、MLPA的中文 2、MLPA的原理 3、MLPA的实验步骤 4、MLPA的应用 第六章 第一节 多重连接探针扩增(MLPA)技术 Thanks！ 《临床基因组学检验》 第六章 第二节 片段分析(FA)技术 第二节 片段分析技术 教学目的与要求 【掌握】 1、片段分析技术原理 2、片段分析技术实验操作 【熟悉】 1、片段分析技术特点 2、片段分析技术临床应用 3、片段分析技术结果分析、解读 【了解】 1、片段分析技术新发展 2、片段分析技术常见问题的解决方法 一、片段分析技术原理 二、片段分析技术特点 三、片段分析技术实验操作、结果分析 四、片段分析技术的临床应用 第六章 第二节 片段分析 目录 《临床基因组学检验》 五、片段分析技术常见问题 一、片段分析技术原理 片段分析技术（fragment analysis，FA） 是一种分子生物学技术。 片段指以DNA或cDNA为模板，由PCR过程所产生的、数目不等的核苷酸构成的大小不等的DNA片段。 对这些片段，利用其大小或标记荧光的差异进行分析的方法即为FA。 一、片段分析技术原理 动态突变 指DNA中的碱基重复序列拷贝数发生扩增而导致的突变。 重复单位片段的大小从3个碱基到33个碱基长不等。如CAG重复 在基因的编码区、3’或5’-UTR、启动子区、内含子区出现三核苷酸重复，及其他长短不等的小卫星、微卫星序列的重复拷贝数 在减数分裂或体细胞的有丝分裂过程中发生扩增而造成遗传物质的不稳定状态。 一、片段分析技术原理 Std-PCR(Standard PCR)，标准PCR 是最传统的检测方法， 通过在重复区的两侧设计引物进行扩增，检测扩增片断的长度来间接计算长度。理论上，扩增片断的长度减去非重复区的长度即为重复片断的长度，除以3即重复的次数。 Std-PCR(Standard PCR)，标准PCR 一、片段分析技术原理 TP-PCR(Triplet Primer PCR)，三重引物PCR 理论上而言可以用于检测所有类型的短串连重复序列。 这种方法可避免Std-PCR无法可能漏检超长重复序列的固有缺陷。 TP-PCR(Triplet Primer PCR)，三重引物PCR PCR的反向引物被设计与致病基因的重复单元进行杂交。各种大小不一的序列在三重PCR反应中被扩增出来。 如果重复数量增加了，一个明显的PCR产物轮廓（梯形轮廓）会在峰图中出现。 TP-PCR技术的优势在于：无论重复数目长度有多少，总是有一定量的产物产生能够指示扩增的重复数目的存在。 缺点在于：同一份样本的不同重复数目的等位基因所产生的信号会相互干扰，造成重复数目的定量不准。 TP-PCR(Triplet Primer PCR)，