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药学院09级本科生“生物化学”测验(一)
2010. 10. 8 下午 考试方式:开卷,独立完成
姓名: 学号: 成绩:
1. 酸完全水解法进行蛋白质的氨基酸组成分析,在还原性条件下哪三种氨基酸无法测定?请给予合理解释。 (10分)
答:Gln, Asn和Trp。Gln和Asn酸水解后转变为两个相应的酸性氨基酸Glu和Asp,而色氨酸在酸性条件下不稳定,发生降解。
2. 脯氨酸与其他19种基本氨基酸比较,结构上有何区别?试从结构出发,总结出该氨基酸在蛋白质二级结构形成和蛋白酶降解两个方面的特点。 (15分)
答:脯氨酸的?-氨基与侧链的末端碳形成了环,因此是仲胺(其他氨基酸均为伯胺)。由于仲胺不能与其他氨基酸的羰基形成氢键,并且成环后的C?-N键不能自由旋转,具有刚性,使得蛋白质肽链不能在此处形成?-螺旋结构,而容易形成?-turn结构。另一方面,由于环结构造成的空间位阻,蛋白酶不易水解由脯氨酸?-氨基形成的肽键。
3. 写出六肽Ala-Thr-Val-Asp-Ala-Lys的化学结构,计算该肽的pI,并指出该肽在pH = 8时的带电情况。 (20分)
答:结构式:
pI = (3.89 + 9.69) / 2 = 6.78
pH = 8时, ?P = pI-pH = 6.78 – 8 = -1.22, 因此该肽此时带负电荷。
4. 根据以下分析结果确定蛋白质的亚基数目及连接方式:
(1)凝胶过滤测得分子量为200 KD;
(2)SDS测得分子量为100 KD;
(3)2-巯基乙醇存在下的SDS测得分子量为40 KD和60 KD (15分)
答:4个亚基。其中包括两条40 KD的肽链和两条60 KD的肽链。
每条40 KD的肽链通过二硫键与一条60 KD的肽链相连接,组成两个分子量100 KD的含链间二硫键的单元,两个单元间通过非共价键构成整个蛋白质分子。
5. A peptide chain of polylysine coils into an ?-helix in solution at pH 13; however, it become a random coil at pH 7. Explain? (10分)
答:因为在pH 7时,赖氨酸的侧链氨基带有正电荷,导致产生电荷排斥作用,不利于形成相对紧密的?-helix结构,只能形成松散的环构象。而在pH 13时,侧链氨基以游离形式存在,无电荷相互排斥作用,易于形成?-helix这种二级结构形式。
6. Yogurt(酸奶) is produced from milk by the action of dairy bacteria. These bacteria produce lactic acid(乳酸) as a by-product of their metabolism. The pH decrease causes the milk proteins to coagulate. Why are food preservatives(防腐剂)not required to inhibit the growth of bacteria in yogurt? (10分)
答:由于乳酸的产生导致酸奶的pH值下降,低的pH条件不仅使牛奶蛋白产生凝固现象,而且也使得细菌中的蛋白质发生变性,抑制了细菌的生长。因此不需要对酸奶进行抑菌处理。
7. 从尿素的结构出发,试解释它作为蛋白质变性试剂的作用。 (10分)
答:从尿素结构可以看出,它易与其他分子形成氢键,既可以作为氢键给体(-NH2部分),又可以作为氢键受体(-C=O部分)。因此,尿素可以通过与蛋白质内部的基团形成氢键,来破坏蛋白质分子内部用于维系空间结构的氢键。
8. 肌红蛋白和血红蛋白中多肽链的微环境对于其的生物学功能(运输氧气)有哪些重要作用? (10分)
答:1)固定heme于合
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