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质谱 内标等知识.docVIP

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质谱定量的原则 内标的选择 HYPERLINK \t "_blank ?内标.gif 图1 内标的量 ?? 大规模质谱法简介 ?????? 目前, 研究人员 们正在通过各种方法使大规模 质谱 法变得更有效,而且将这一技术工具缩小化。 ????????? 大规模 质谱法 对于药物的发现来说是一个无法比拟的有力工具,而且它在定性与 定量分析 的应用中有着很大的价值。虽然大规模质谱法的应用能力和敏感性被不断的改进,但是在药物发现研究里面的技术改革只是出现在专门的工具和应用中。这一技术工具的发展有着三大趋势:减少 样品处理 与准备工作,辅以数据分析,促进可携带性和多 功能性 。 ????????? 样品处理 ???????? 样品处理和准备是 质谱技术 分析中最耗体力的步骤。通常,要获得一个足够纯度的样品需要两个或更多的分离步骤。市场上的许多仪器通过整合一个化学分离步骤来减少这些劳动量。市场上最新的能大幅减轻劳动量的技术是由日本Shimadzu 公司的 科学家 改进的,这一技术通过机械化样品处理和化学喷墨打印机,被用于直接分析Western blot 实验中的蛋白。Shimadzu 科学家用化学打印法在Western blot薄膜上点上 胰岛素 来消化蛋白质,然后应用基质溶液和 基质辅助 激光解吸离子化快速质谱技术(MALDI-TOF)对膜上的样品进行直接 质谱分析 。 ??????? 通过以上分析, 研究员 能够从一次 免疫印迹 实验中的任意多个点得到蛋白质质谱印记,PMF数据,或整个蛋白质情况。Shimadzu 科学家约瑟夫.福克斯博士说:“你能通过一个blot分析做很多事情。可以想像得到,这一技术不仅使药物或小分子 化合物 的找寻工作得以很好的进行,并且对于生物标记或蛋白质的找寻工作也有同样的作用。”Shimadzu 说这一方法的优势在于对于一个蛋白质,其质量的数据能从它最初被识别的blot中提取,并非跑一块新胶切下条带用于质谱分析。探索一块凝胶上的大量难懂的条带需要花费几个月的时间,而这项技术通过从Western blot中提取PMF数据可以节省时间并且排除人为错误。 ???????? 自动化 、机械化和最小的样品处理也是Shimadzu 的新器具LCMS-IT-TOF的主要特点。 这一仪器在离子喷入 TOF 室前通过一个四级杆离子陷阱 探测器 聚焦于离子,因此有着极高的敏感性。 ???????? LC/MS能与一个自动取样器一起进行流水化工作。Shimadzu 的HPLC产品经理Chris Campbell说:“在把样品放在 质谱仪 器里之前,人们总是希望尽可能少对样品做处理。样品自动清理是许多质谱仪器使用者梦寐以求的事情。” ??????? 软件分析 ???????? 第二个快速革新的领域是质谱技术的软件包。在过去几年中,质谱技术器具敏感性和生产量都得到提高,使得人工数据分析的劳动强度越来越大。生物系统的应用促进了新的敏感型的四级杆 飞行时间 Qstar Elite LC/MS/MS TOF 质谱仪上市。依照公司、软件特征与器具联合使工作流程流线化,而且能更理性的收集数据。以 代谢物 表面构型确定为目标的Qstar,据报道能够以最快每秒七个前体离子的速度获得完全扫描的质谱数据。它的独立数据获得软件的特色是一个专有的算法,这个算法叫做动态背景减少算法(DBS),该算法能够使质谱仪为收集数据而选择离子时变得“更聪明”。这个算法收集了20个调查扫描而且分析了那些扫描中出现的所有离子。与一条相对于时间的强烈的衰退线对比,以最大速度上升的离子能够被选取作为MS/MS数据的收集。 ???????? 第二个数据管理技术叫做质量差引发独立数据获得技术(MDT IDA)。这一技术通过对比前体化合物与代谢产物在代谢物表面结构确定中的质量差,进一步减少用于MS/MS数据获得的可选化合物数量。 ???????? 快捷便利 ????????? 奥地利 的Biocrates 生命科学 公司已经开发了一个平台,可以用来从液体样品(如尿液,血浆,或是 细胞培养 液)中 一次性 识别并定量1,000多种代谢物。Biocrates称,这种工具已经超越了采用美国应用生物系统公司的设备提供的数据过滤工具,能够一次性对整个代谢过程进行全面分析。Biocrates公司首席执行官 Armin Graber表示,采用最前沿的自动化样品 预处理 工具,公司已经为一些疾病地区快速直接的 代谢组学 分析创立了方法。根据Graber所说,这间只有15名职员的公司一天能做500个样品。他还说:“我们已经选择好了代谢产物,我们预先知道该使用哪些设备,哪一个生化途径起了作用,哪些疾病是相关的。我们预先注释了我们所有的代谢信息。” ???????? Graber说:“蛋白质的一大优

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