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从20世纪中叶开始,分子生物学研究得到高速
发展,主要原因之一是研究方法,特别是基因操作
和基因工程技术的进步。
基因操作主要包括DNA分子的切割与连接、核
酸分子杂交、凝胶电泳、细胞转化、核酸序列分析
以及基因人工合成、定点突变和PCR扩增等,是分
子生物学研究的核心技术。
基因组DNA提取技术
凝胶电泳技术
第一节凝胶电泳技术
一、常规电泳
琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳
二、脉冲凝胶电泳
·自从琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶被引入核酸研究以来,按分子量大小
分离DNA的凝胶电泳技术,已经发展成为一种分析鉴定重纽DNA
分子及蛋白质与核酸相互作用的重要实验手段,也是现在通用的许
多分子生物学研究方法,如:DNA分型、DNA核苷酸序列分析、
限制性内切酶片段分析以及限制酶切作图等的技术基础,受到科学
界的高度重视。
基本原理:生物大分子在一定pH条件下,通常会带电荷。将其放
置到电场中,就会以一定的速度移向适当的电极。分子在电场作用
下的迁移速度,与电场强度和电泳分子所槜带的净电荷数成正比,
与分子的摩擦系数成反比。摩擦系数是分子大小、极性及介质粘度
电泳将蛋白质或核酸分子混合物中的各种成分彼此分。’可通过
的函数。根据分子大小、构型或形状的差异和带净电荷数
在生理条件下,核酸分子之糖_磷酸骨架中的磷酸基国,是呈离子
化状态的,所以,DNA和RNA多核苷酸链又被称为多聚阴离子
polyanions),把这些核酸分子放置在电场当中,它们就会向正
电极的方向迁移。由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数
量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速度
向正电极方向迁移。在一定的电场强度下,DNA分子的这种迁移
速度,亦即电泳的迁移率,取决于核酸分子本身的大小和构型。这
就是应用凝胶电泳技术分离DNA片段的基本原理。
5
1、琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳是一种简便、快速、最常用的
分离纯化和鉴定核酸的方法
琼脂糖是从海藻中提取的一种线状高聚物
·根据琼溶解温度,把琼脂糖分为一般琼脂糖和
低熔点琼脂糖
·低熔点琼脂糖熔点为62~65℃,溶解后在37℃
下维持液体状态约数小时,主要用于DNA片段
的回收,质粒与外源性DNΔ的快速连接等
1)凝胶浓度选择
琼脂糖凝胶浓度与DNA分离范围
凝胶的分辨能力琼脂糖浓线型DNA分子的分
同凝胶的类型和浓
度(%)
离范围(Kb)
度有关,凝胶浓度
0.3
5~60
的高低影响凝胶介
质孔隙的大小,浓
0.6
~20
度越高,孔隙越小
0.7
0.8~10
,其分辨能力就越
0.9
0.5~7
强。反之,浓度降
09~6
低,孔隙就增大,
1.5
其分辨能力也就随
0.2~3
之减弱。
12.0
0.1~2
2)电咏缓冲液
·常用三种缓冲液
Tris-硼酸(TBE)
Ttis-乙酸(TAE)
Tris-磷酸(TPE)
TB与TPE:缓冲容量高,DNA分离效果
好,但TPE在DNA片段回收时含磷酸盐浓
度高,容易使DNA沉淀
TAE:缓冲容量低,但价格较便宜。缓冲
液中的EDTA可螯合二价阳离子,从而抑
制DNA酶的活性,防止PCR扩增产物降解
4)栽枰缓冲液
指示剂一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖
400组成载样缓冲液
作用:
①增加样品密度,使其比重增加,以
确保DNA均匀沉入加样孔内
②在电泳中形成肉眼可见的指示带,
可预测核酸电泳的速度和位置
③使样品呈色,使加样操作更方便
在紫外线的照射下结合溴化乙锭的
DNA分子发出荧光
在凝胶电泳中,加入适
量澳化乙锭( ethidium
123
bromide,简称EBr)染
料对核酸分子进行染色
,然后将电泳标本放置
在紫外光下观察,可十
分灵敏而快捷地检测出一==m
凝胶介质中DNA的谱带
部位,即使每条DNA带2
中仅含有0.054g的微量
DNA,也可以被清晰地
检测出来。
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