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生物信息学技术;
一、生物信息学的定义;Half day on the web,;4;人类基因组计划的意义;
二、生物信息学研究的范畴; 重要生物信息中心
重要生物信息数据库;数据库的建设和发展; NCBI GenBank
EBI EMBL
NIG DDBJ;重要生物信息中心数据库; 最重要的蛋白质氨基酸序列数据库是瑞士的SWISS-
PROT (/sprot/);
蛋白质数据库PIR(Protein Information Resource),包含
所有序列已知的自然界中野生型蛋 白质的信息
();
PDB蛋白质结构数据库:收集由X射线衍射和核磁共振
技术测定的蛋白质大分子三维结构(/pdb)。;;;数据库查询与检索;数据库检索工具;数据库检索工具;文献检索;文献检索;文献检索;核酸数据分析;OUTLINE;一、核酸序列的基本分析;一、核酸序列的基本分析;★ NCBI网页的Map Viewer界面;程序名称;26;NCBI网页的BLAST界面;28;29;30;NCBI网页的BLAST2 SEQUENCES界面;32;;二、核酸序列的比对分析和功能预测;二、核酸序列的比对分析和功能预测;第五节 核酸序列分析
三、开读框的分析;用GeneFinde进行开放阅读框分析;用GeneFinde进行开放阅读框分析;
四、引物设计;
五、向数据库提交核酸序列;;第六节 蛋白质序列分析★;
一、蛋白质基本性质分析;44;45;46;47;用TMHMM 软件预测的SARS-CoV 的E蛋白的跨膜区;第六节 蛋白质序列分析
一、蛋白质基本性质分析;预测信号肽;预测信号肽;蛋白质亚细胞定位;蛋白质亚细胞定位;
二、蛋白质功能预测; ;
三、蛋白质结构预测; 同源建模(Homology modeling)分析服务
(http://www.expasy.ch/swissmod/sm_toppage.html)
常用的有以下几个工具:
TOPITS:
http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein
frsvr: /people/frsvr/frsvr.html
THREADER: http://globin.warwick.ac.uk/~jones/;58;
四、蛋白质分子进化分析 ;
四、蛋白质分子进化分析 ;此课件下载可自行编辑修改,仅供参考!感谢您的支持,我们努力做得更好!谢谢
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