柳莺属五种鸟类线粒体全基因组测定分析及通用SSR标记开发.pdfVIP

柳莺属五种鸟类线粒体全基因组测定分析及通用SSR标记开发 摘 要 柳莺属(Phylloscopus)是隶属雀形目(Passeriformes)、莺总科(Sylvioidea)、柳莺科 (Phylloscopidae)，全球柳莺属鸟类共约66种、112个亚种。柳莺属鸟类种间形态相似、同 域分布种数较多，在物种分类、野外识别、系统发育等方面存在诸多困难，历来是鸟类分 类学研究的难点。 本研究首先利用一代测序技术，测定了柳莺属5个物种的线粒体全基因组序列，然后 结合已公布的黄眉柳莺(Phylloscopus inornatus)和黄腰柳莺(Phylloscopusproregulus)线粒体 全基因组序列，对7个物种的碱基组成、蛋白编码基因和系统发育情况等进行了分析，最 后利用RAD 简化基因组测序技术，开发了27对通用于6种柳莺属鸟类的微卫星引物。主 要研究结果如下： 1、五种柳莺属鸟类的线粒体基因组结构和特征 五种柳莺属鸟类线粒体全基因组长度分别为：灰脚柳莺Phylloscopus tenellipes (16,904 bp)、冕柳莺Phylloscopus coronatus (16,905bp)、极北柳莺Phylloscopus borealis (