2020第7讲蛋白质性质和结构预测.pptVIP

无信号肽 5 ，跨模结构分析 ? 跨膜结构一般在蛋白质结构 中序列的相似性不大，但结 构却极其相似，因此在序列 搜索中可能没有很显著的结 果，所以常用的 BLAST 之 类的相似性或者同源性搜索 就无效。 G 蛋白耦联型受体为 7 次跨膜蛋白 TMpred ? /software/TMPRED_form.html 算法简介 ? The TMpred program makes a prediction of membrane- spanning regions and their orientation. The algorithm is based on the statistical analysis of TMbase, a database of naturally occuring transmembrane proteins. The prediction is made using a combination of several weight-matrices for scoring 。 ? TMpred 程序预测跨膜区和它们的方向。该算法是基于对 TMbase 的统计分析， TMbase 是一个自然发生的跨膜蛋 白数据库。作出的预测是通过几个权重计分矩阵的结合得 到的。 序列 gi|4506183|ref|N