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DNA提取中各种实验试剂作用原理
1、STE 是 Tris-Hcl 、EDTA、Nacl 的混合液 。其总体作用是为 DNA提供保护环境,在此环
境下 DNA可以呈稳定态,最少限度地受到破坏。
Tris.HCl 提供缓冲体系, DNA在这一体系中呈稳定态。
EDTA:是 DNA酶的抑制剂,可以防止细胞破碎后 DNA酶降解 DNA。
NaCl,有利于 DNA的溶解。
2、SDS的作用:利用高浓度的阴离子去垢剂 SDS(十二烷基磺酸钠, Sodium dodecyl sulfate )
使 DNA 与蛋白质分离,在高温( 55~ 65℃)条件下裂解细胞,使染色体离析,蛋白变性,
释放出核酸,然后采用提高盐浓度及降低温度的方法使蛋白质及多糖杂质沉 淀,离心后除
去沉淀,
3、苯酚的作用:使蛋白质变性,同时抑制了 DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由
于蛋白与 DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子
溶于酚相,而 DNA溶于水相。
使用酚的优点:
1. 有效变性蛋白质;
2. 抑制了
DNase的降解作用。
缺点:
1.
能溶解
10-15%的水,从而溶解一部分
poly
( A) RNA。 2.
不能完全抑制
RNase的
活性。
Tris 酚的颜色,一般为黄色。如果变成粉红色,说明被氧化,不能再用。
4、氯仿的作用
克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。 (酚易溶于氯仿中)
5、异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少
气泡产生。 另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含 DNA的水相、 中间的变性蛋白相及
下层有机溶剂相维持稳定。
6、用乙醇沉淀 DNA时,为什么加入单价的阳离子?
用乙醇沉淀 DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如 NaCl 或 NaAc ,Na+中和 DNA分
子上的负电荷,减少 DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
7.为什么在保存或抽提 DNA过程中,一般采用 TE 缓冲液?
在基因操作实验中, 选择缓冲液的主要原则是考虑 DNA的稳定性及缓冲液成分不产生干扰作
用。磷酸盐缓冲系统( pKa= 7.2 )和硼酸系统( pKa=9.24 )等虽然也都符合细胞内环境的生
理范围
(pH) ,可作
DNA的保存液,但在转化实验时,磷酸根离子的种类及数量将与
Ca2+产
生 Ca3(PO4)2 沉淀,在
DNA反应时, 不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,
有的要求
高离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用 Tris-HCl ( pKa=8.0 )的缓冲系统,由于缓冲液是
TrisH+/Tris
,不存在金属离子的干扰作用,故在提取或保存
DNA 时,大都采用
Tris-HCl
系统,而
TE 缓冲液中的
EDTA更能稳定
。
8、STE 是
Tris-Hcl
、EDTA、Nacl
的混合液
。其总体作用是为
DNA提供保护环境,在此环
境下 DNA可以呈稳定态,最少限度地受到破坏。
Tris.HCl 提供缓冲体系, DNA在这一体系中呈稳定态。
EDTA:是 DNA酶的抑制剂,可以防止细胞破碎后 DNA酶降解 DNA。
NaCl,有利于 DNA的溶解。
9、SDS的作用:利用高浓度的阴离子去垢剂 SDS(十二烷基磺酸钠, Sodium dodecyl sulfate )
使 DNA 与蛋白质分离,在高温( 55~ 65℃)条件下裂解细胞,使染色体离析,蛋白变性,
释放出核酸,然后采用提高盐浓度及降低温度的方法使蛋白质及多糖杂质沉 淀,离心后除
去沉淀,
10、苯酚的作用:使蛋白质变性,同时抑制了 DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由
于蛋白与 DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子
溶于酚相,而 DNA溶于水相。
使用酚的优点:
1. 有效变性蛋白质;
2. 抑制了
DNase的降解作用。
缺点:
1.
能溶解
10-15%的水,从而溶解一部分
poly
( A) RNA。 2.
不能完全抑制
RNase的
活性。
Tris 酚的颜色,一般为黄色。如果变成粉红色,说明被氧化,不能再用。
11、氯仿的作用
克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。 (酚易溶于氯仿中)
5、异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少
气泡产生。 另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含 DNA的水相、 中间的变性蛋白相及
下
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